69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3891 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  100 
 
 
113 aa  231  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  100 
 
 
113 aa  231  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  63.89 
 
 
111 aa  140  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3495  cytochrome c class I  55.77 
 
 
104 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4618  cytochrome c, class I  61.8 
 
 
111 aa  121  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2542  putative cytochrome C6-2  53.04 
 
 
115 aa  120  8e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0112262  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0879  cytochrome c class I  50.44 
 
 
111 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0993  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  52.33 
 
 
104 aa  99.4  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  42.99 
 
 
111 aa  91.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0899  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  47.73 
 
 
112 aa  90.5  8e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18191  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  46.59 
 
 
125 aa  90.1  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  43.4 
 
 
110 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0239  cytochrome C6 soluble cytochrome f  44.83 
 
 
112 aa  86.7  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.783441 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  38.1 
 
 
111 aa  85.9  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0010  cytochrome c  40.91 
 
 
123 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06291  hypothetical protein  45.45 
 
 
123 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  37.27 
 
 
111 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  37.27 
 
 
111 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3862  cytochrome c class I  40 
 
 
111 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  37.61 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3983  cytochrome c class I  41.12 
 
 
111 aa  77.8  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1014  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  33.9 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156053  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05781  hypothetical protein  42.68 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17581  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  37.96 
 
 
115 aa  77  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2744  cytochrome c, class I  38.61 
 
 
121 aa  73.9  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0915  cytochrome c6  41.38 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.133204  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44056  cytochrome c6, cytochrome c553  43.02 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0959  cytochrome c class I  32.26 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.809714  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0716  cytochrome c  32.38 
 
 
117 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.459655  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07721  cytochrome c  30.48 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2743  cytochrome c family protein  36.71 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1585  cytochrome c class I  32.43 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0558  cytochrome c family protein  34.57 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.271459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2432  cytochrome c family protein  33.33 
 
 
104 aa  52  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2183  cytochrome c, class I  28.04 
 
 
110 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2628  cytochrome c class I  31.08 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0155  cytochrome c, class I  34.67 
 
 
110 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2044  cytochrome c, class I  32.91 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.81366e-16 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47332  predicted protein  28.92 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0518797  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3887  cytochrome c class I  33.33 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.389814 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  35.56 
 
 
212 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1425  cytochrome c, class I  32.43 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0331  cytochrome c, class I  31.76 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2435  cytochrome c class I  32.43 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  32.47 
 
 
101 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  31.51 
 
 
284 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  35.44 
 
 
270 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0957  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.56 
 
 
723 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12457  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2522  cytochrome c class I  33.33 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  32.53 
 
 
278 aa  42.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  35.71 
 
 
251 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0342  putative cytochrome c55X precursor  24.72 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 
513 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  30.86 
 
 
195 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3341  cytochrome c class I  32.91 
 
 
295 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  34.12 
 
 
518 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0317  cytochrome c, class I  33.75 
 
 
285 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00320646 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0462  Hydroxylamine reductase  29.09 
 
 
553 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000301578  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  28.12 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  32.94 
 
 
518 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  30.12 
 
 
273 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  26.14 
 
 
201 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  30.38 
 
 
272 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  32.94 
 
 
518 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  30.38 
 
 
272 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1877  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.72 
 
 
325 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.020094  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  30.38 
 
 
272 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  32.94 
 
 
513 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  33.33 
 
 
275 aa  40  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>