35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2432 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2432  cytochrome c family protein  100 
 
 		 104 aa  207  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1585  cytochrome c class I  48.78 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2628  cytochrome c class I  48.78 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2743  cytochrome c family protein  42.11 
 
 		 111 aa  87.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0155  cytochrome c, class I  46.34 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0331  cytochrome c, class I  41.38 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0558  cytochrome c family protein  46.15 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.271459  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2183  cytochrome c, class I  41.1 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2044  cytochrome c, class I  40.26 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.81366e-16 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  35.37 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  35.37 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3495  cytochrome c class I  32.99 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  32 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  33.87 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17581  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  38.27 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  33.87 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4618  cytochrome c, class I  35 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0993  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  35.63 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  31.58 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  26.92 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0899  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  34.25 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18191  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  34.33 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0879  cytochrome c class I  30.38 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  29.41 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05781  hypothetical protein  34.38 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0239  cytochrome C6 soluble cytochrome f  32.26 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.783441 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2542  putative cytochrome C6-2  31.58 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0112262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47332  predicted protein  25 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0518797  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44056  cytochrome c6, cytochrome c553  30.77 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6090  cytochrome c class I  31.63 
 
 		 446 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2744  cytochrome c, class I  30 
 
 		 121 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06291  hypothetical protein  32.31 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0959  cytochrome c class I  30 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.809714  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3862  cytochrome c class I  30.23 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>