37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6090 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6090  cytochrome c class I  100 
 
 		 446 aa  904    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0718  cytochrome c class I  30.42 
 
 		 457 aa  186  6e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0002252  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0453  hypothetical protein  30.49 
 
 		 357 aa  114  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2630  hypothetical protein  31.13 
 
 		 355 aa  96.3  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1763  hypothetical protein  33.69 
 
 		 355 aa  95.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0369  hypothetical protein  27.99 
 
 		 535 aa  87  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2530  hypothetical protein  25.81 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0292  hypothetical protein  27.42 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2571  hypothetical protein  26.67 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0684  hypothetical protein  30.43 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.265047  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2025  hypothetical protein  28.06 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2549  hypothetical protein  36 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000354774  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1847  hypothetical protein  30.41 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0758  hypothetical protein  27.14 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.230077  normal  0.507347 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2670  hypothetical protein  30.19 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000667877  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3899  hypothetical protein  30 
 
 		 399 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00043819  normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0597  hypothetical protein  31.25 
 
 		 399 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000441286  unclonable  0.00000859412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5190  hypothetical protein  29.2 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1186  hypothetical protein  28.07 
 
 		 401 aa  51.2  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.215459  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1106  hypothetical protein  31.65 
 
 		 509 aa  50.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.875896 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0043  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.33 
 
 		 575 aa  49.3  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1037  cytochrome c class I  36.17 
 
 		 96 aa  47  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.692369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  30.46 
 
 		 278 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  30.46 
 
 		 278 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  30.46 
 
 		 278 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  31.31 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7278  cytochrome c class I  37.84 
 
 		 138 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3082  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  36.67 
 
 		 208 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2419  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.52 
 
 		 298 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.203271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  36.45 
 
 		 360 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  39.44 
 
 		 218 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1566  diheme cytochrome c  31.25 
 
 		 324 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  27.38 
 
 		 280 aa  43.9  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  36.08 
 
 		 277 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3648  cytochrome c class I  29.03 
 
 		 135 aa  43.5  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  34.57 
 
 		 143 aa  43.1  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1783  cytochrome c, class I  36 
 
 		 106 aa  43.1  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>