18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1763 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1763  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  692    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0453  hypothetical protein  44.54 
 
 
357 aa  306  3e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2630  hypothetical protein  41.62 
 
 
355 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0292  hypothetical protein  39.89 
 
 
367 aa  230  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0758  hypothetical protein  39.04 
 
 
354 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.230077  normal  0.507347 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2530  hypothetical protein  36.27 
 
 
381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2571  hypothetical protein  41.25 
 
 
366 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6090  cytochrome c class I  33.51 
 
 
446 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0718  cytochrome c class I  27.94 
 
 
457 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0002252  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0684  hypothetical protein  26.94 
 
 
408 aa  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.265047  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0369  hypothetical protein  29.25 
 
 
535 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2025  hypothetical protein  25.57 
 
 
399 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1847  hypothetical protein  28.49 
 
 
409 aa  64.7  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3899  hypothetical protein  29.22 
 
 
399 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00043819  normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0597  hypothetical protein  29.14 
 
 
399 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000441286  unclonable  0.00000859412 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1186  hypothetical protein  33.99 
 
 
401 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.215459  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5190  hypothetical protein  32.03 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2670  hypothetical protein  24.14 
 
 
399 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000667877  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>