18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0758 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0758  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  691    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.230077  normal  0.507347 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2530  hypothetical protein  48.4 
 
 		 381 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0453  hypothetical protein  47.61 
 
 		 357 aa  292  7e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2630  hypothetical protein  41.04 
 
 		 355 aa  259  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0292  hypothetical protein  44.75 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1763  hypothetical protein  39.04 
 
 		 355 aa  247  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2571  hypothetical protein  34.6 
 
 		 366 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6090  cytochrome c class I  28.14 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0684  hypothetical protein  31.61 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.265047  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0718  cytochrome c class I  23.57 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0002252  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1186  hypothetical protein  33.55 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.215459  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1847  hypothetical protein  30.64 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0597  hypothetical protein  28.57 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000441286  unclonable  0.00000859412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5190  hypothetical protein  30 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3899  hypothetical protein  28.75 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00043819  normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2025  hypothetical protein  28.57 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2670  hypothetical protein  27.7 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000667877  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0369  hypothetical protein  28.86 
 
 		 535 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>