142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0718 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0718  cytochrome c class I  100 
 
 
457 aa  932    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0002252  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6090  cytochrome c class I  30.42 
 
 
446 aa  186  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3236  cytochrome c class I  59.74 
 
 
647 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0631004  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4773  cytochrome c class I  50.56 
 
 
669 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358642  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2630  hypothetical protein  26.29 
 
 
355 aa  95.5  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0453  hypothetical protein  26.52 
 
 
357 aa  92.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3134  cytochrome c, class I  53.16 
 
 
129 aa  89.7  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3610  hypothetical protein  51.35 
 
 
180 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.853045 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6271  cytochrome c class I  52.63 
 
 
663 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000987167  normal  0.709184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2205  cytochrome c class I  40.8 
 
 
656 aa  86.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170192  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1763  hypothetical protein  27.57 
 
 
355 aa  79  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0430  hypothetical protein  39.24 
 
 
122 aa  73.6  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  6.67584e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2530  hypothetical protein  26.95 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0292  hypothetical protein  25.31 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2726  cytochrome C transmembrane protein  40.66 
 
 
106 aa  67.4  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06740  cytochrome c-551 precursor  41.67 
 
 
104 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3648  cytochrome c class I  33.04 
 
 
135 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0619  cytochrome c-551 precursor  41.67 
 
 
104 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0692  cytochrome c, class I  41.67 
 
 
104 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.926342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2099  cytochrome c class I  39.74 
 
 
110 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2196  cytochrome c, class I  40.91 
 
 
106 aa  62  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.252301  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00360  Cytochrome c-551  40.23 
 
 
104 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.66895  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2493  cytochrome c class I  39.74 
 
 
110 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291916  normal  0.0913133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0728  cytochrome c, class I  31.25 
 
 
110 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0783308 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1069  cytochrome c, class I  39.51 
 
 
101 aa  60.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0985  cytochrome c class I  39.51 
 
 
101 aa  60.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1783  cytochrome c, class I  34.83 
 
 
106 aa  60.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2468  cytochrome c, class I  41.77 
 
 
115 aa  60.5  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.202233  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  35.58 
 
 
909 aa  60.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3346  cytochrome c, class I  38.95 
 
 
100 aa  60.1  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.817826  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  40.51 
 
 
218 aa  59.7  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1504  cytochrome c, class I  42.86 
 
 
101 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.125489 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0304  cytochrome c, class I  38.04 
 
 
101 aa  59.3  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.45467e-21  normal  0.0822288 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7278  cytochrome c class I  37.5 
 
 
138 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1852  cytochrome c, class I  31.58 
 
 
108 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2463  cytochrome c, class I  31.58 
 
 
108 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0684  hypothetical protein  25.63 
 
 
408 aa  58.9  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.265047  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2468  cytochrome c class I  31.58 
 
 
108 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3321  cytochrome c, class I  40.74 
 
 
102 aa  58.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  hitchhiker  0.0021347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2050  cytochrome c, class I  40 
 
 
105 aa  57.4  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0434258 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2405  cytochrome c family protein  39.51 
 
 
105 aa  57  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  32.61 
 
 
249 aa  57  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0318  cytochrome c class I  43.21 
 
 
114 aa  57  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00066919  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3171  cytochrome c, class I  39.51 
 
 
101 aa  57  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4310  putative cytochrome c, class I  30.77 
 
 
118 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  34.12 
 
 
344 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3394  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
120 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2879  cytochrome c, class I  41.05 
 
 
106 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.578668 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3220  cytochrome c, class I  43.48 
 
 
101 aa  56.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294896  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5011  cytochrome c, class I  40.51 
 
 
101 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259324  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2813  cytochrome c, class I  31.52 
 
 
117 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0293  cytochrome c, class I  31.52 
 
 
117 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2749  cytochrome c class I  38.27 
 
 
102 aa  55.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210292  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0274  cytochrome c class I  31.52 
 
 
117 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544484 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  42.31 
 
 
355 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2536  cytochrome c class I  33.75 
 
 
131 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1006  cytochrome c, class I  34.83 
 
 
112 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2122  cytochrome c class I  33.75 
 
 
131 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0344  cytochrome c, class I  40.79 
 
 
102 aa  54.7  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0270928  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0831  cytochrome c class I  34.15 
 
 
145 aa  55.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4930  cytochrome c family protein  39.74 
 
 
229 aa  54.3  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0205  cytochrome c, class I  32.14 
 
 
119 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0219  cytochrome c class I  34.52 
 
 
119 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518209 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1476  cytochrome c class I  29.9 
 
 
111 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1163  cytochrome c class I  36.56 
 
 
197 aa  54.3  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000127727  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3130  cytochrome c class I  35.62 
 
 
115 aa  53.5  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3458  cytochrome c class I  35.62 
 
 
115 aa  53.5  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3082  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  40.26 
 
 
208 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3256  cytochrome c, class I  35 
 
 
108 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2528  cytochrome c class I  35.56 
 
 
101 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0369  hypothetical protein  22.68 
 
 
535 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5897  cytochrome c class I  36.36 
 
 
93 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  48.21 
 
 
941 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2076  cytochrome c class I  41.03 
 
 
140 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5794  cytochrome c, class I  32.53 
 
 
108 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2450  cytochrome c family protein  41.03 
 
 
100 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0342  cytochrome c, class I  37.8 
 
 
108 aa  51.2  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.16869  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2512  cytochrome c, class I  34.15 
 
 
109 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1386  cytochrome c551/c552-like protein  40.51 
 
 
118 aa  51.6  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660069  normal  0.798955 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3728  cytochrome c class I  39.51 
 
 
102 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2222  cytochrome c class I  34.44 
 
 
108 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0408  cytochrome c class I  30 
 
 
116 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0675  cytochrome c family protein  33.73 
 
 
107 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.414538  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0826  cytochrome c subfamily protein  35.29 
 
 
107 aa  51.2  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2336  cytochrome c family protein  33.73 
 
 
107 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.1845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2950  cytochrome c family protein  33.73 
 
 
107 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.25349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1025  cytochrome c family protein  33.73 
 
 
107 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502837  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1650  cytochrome c family protein  33.73 
 
 
107 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3145  cytochrome c family protein  29.76 
 
 
111 aa  50.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2380  cytochrome c class I  34.94 
 
 
109 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1018  cytochrome c family protein  33.73 
 
 
107 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0243798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  25.97 
 
 
302 aa  50.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0200  cytochrome c class I  31.25 
 
 
123 aa  50.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566136  unclonable  0.00000000000521394 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1847  hypothetical protein  30.95 
 
 
409 aa  49.7  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1693  cytochrome c class I  36.59 
 
 
118 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.504006 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3260  cytochrome C transmembrane protein  33.78 
 
 
141 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.812906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  34.15 
 
 
1135 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0021  cytochrome c family protein  30 
 
 
121 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.042023  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1745  cytochrome c family protein  30 
 
 
121 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1488  cytochrome c class I  37.18 
 
 
101 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.02284 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>