17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1847 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1847  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  807    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0684  hypothetical protein  58.56 
 
 		 408 aa  461  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.265047  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1186  hypothetical protein  47.41 
 
 		 401 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.215459  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0542  hypothetical protein  37.17 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2025  hypothetical protein  34.38 
 
 		 399 aa  186  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3899  hypothetical protein  34.05 
 
 		 399 aa  182  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00043819  normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0597  hypothetical protein  33.25 
 
 		 399 aa  182  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000441286  unclonable  0.00000859412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2670  hypothetical protein  32.85 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000667877  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2530  hypothetical protein  32.3 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2630  hypothetical protein  28.44 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0453  hypothetical protein  27.25 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6090  cytochrome c class I  30.41 
 
 		 446 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0758  hypothetical protein  29.2 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.230077  normal  0.507347 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1763  hypothetical protein  27.13 
 
 		 355 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0292  hypothetical protein  29.53 
 
 		 367 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5190  hypothetical protein  29.89 
 
 		 402 aa  50.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0718  cytochrome c class I  30.95 
 
 		 457 aa  49.7  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0002252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>