18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2630 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2630  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  713    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0453  hypothetical protein  47.08 
 
 
357 aa  301  1e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1763  hypothetical protein  40.87 
 
 
355 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2530  hypothetical protein  38.38 
 
 
381 aa  243  5e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0758  hypothetical protein  41.04 
 
 
354 aa  235  7e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.230077  normal  0.507347 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0292  hypothetical protein  39.39 
 
 
367 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2571  hypothetical protein  35.41 
 
 
366 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6090  cytochrome c class I  31.13 
 
 
446 aa  96.3  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0718  cytochrome c class I  26.29 
 
 
457 aa  95.5  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0002252  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0684  hypothetical protein  31.45 
 
 
408 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.265047  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1847  hypothetical protein  28.44 
 
 
409 aa  62.4  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0369  hypothetical protein  24.89 
 
 
535 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5190  hypothetical protein  29.17 
 
 
402 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1186  hypothetical protein  30.57 
 
 
401 aa  61.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.215459  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2025  hypothetical protein  27.08 
 
 
399 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3899  hypothetical protein  26.83 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00043819  normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0597  hypothetical protein  27.5 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000441286  unclonable  0.00000859412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2670  hypothetical protein  25.23 
 
 
399 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000667877  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>