18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1186 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1186  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  789    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.215459  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1847  hypothetical protein  47.41 
 
 
409 aa  364  1e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0684  hypothetical protein  48.51 
 
 
408 aa  361  2e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.265047  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0542  hypothetical protein  34.41 
 
 
397 aa  206  8e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3899  hypothetical protein  34.99 
 
 
399 aa  182  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00043819  normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2025  hypothetical protein  33.76 
 
 
399 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0597  hypothetical protein  34.15 
 
 
399 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000441286  unclonable  0.00000859412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2670  hypothetical protein  33.5 
 
 
399 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000667877  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0453  hypothetical protein  29.52 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2630  hypothetical protein  30.57 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2530  hypothetical protein  31.86 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0292  hypothetical protein  29.27 
 
 
367 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1763  hypothetical protein  33.99 
 
 
355 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0758  hypothetical protein  32.12 
 
 
354 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.230077  normal  0.507347 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2571  hypothetical protein  29.17 
 
 
366 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6090  cytochrome c class I  28.07 
 
 
446 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0718  cytochrome c class I  30 
 
 
457 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0002252  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5190  hypothetical protein  28.7 
 
 
402 aa  46.6  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>