19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0453 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0453  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  705    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1763  hypothetical protein  44.54 
 
 		 355 aa  309  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2630  hypothetical protein  46.17 
 
 		 355 aa  301  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2530  hypothetical protein  45.58 
 
 		 381 aa  279  5e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0758  hypothetical protein  47.61 
 
 		 354 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.230077  normal  0.507347 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0292  hypothetical protein  40.83 
 
 		 367 aa  247  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2571  hypothetical protein  37.89 
 
 		 366 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6090  cytochrome c class I  28.3 
 
 		 446 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0718  cytochrome c class I  25.48 
 
 		 457 aa  97.1  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0002252  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0369  hypothetical protein  31.47 
 
 		 535 aa  89.4  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0684  hypothetical protein  27.86 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.265047  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1186  hypothetical protein  29.52 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.215459  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1847  hypothetical protein  27.97 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3899  hypothetical protein  29.03 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00043819  normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5190  hypothetical protein  29.35 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0597  hypothetical protein  28.95 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000441286  unclonable  0.00000859412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2025  hypothetical protein  28.95 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2670  hypothetical protein  29.41 
 
 		 399 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000667877  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0542  hypothetical protein  23.91 
 
 		 397 aa  43.1  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>