17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5190 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5190  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  774    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2630  hypothetical protein  29.17 
 
 
355 aa  60.8  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0453  hypothetical protein  27.69 
 
 
357 aa  60.5  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2571  hypothetical protein  33.73 
 
 
366 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1763  hypothetical protein  32.03 
 
 
355 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2530  hypothetical protein  28.99 
 
 
381 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0292  hypothetical protein  38.38 
 
 
367 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0758  hypothetical protein  34.52 
 
 
354 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.230077  normal  0.507347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6090  cytochrome c class I  29.2 
 
 
446 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0684  hypothetical protein  24.75 
 
 
408 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.265047  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1847  hypothetical protein  29.89 
 
 
409 aa  50.1  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3899  hypothetical protein  30.46 
 
 
399 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00043819  normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2670  hypothetical protein  29.66 
 
 
399 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000667877  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1186  hypothetical protein  28.7 
 
 
401 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.215459  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0369  hypothetical protein  38.6 
 
 
535 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0542  hypothetical protein  22.6 
 
 
397 aa  43.1  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0597  hypothetical protein  27.85 
 
 
399 aa  42.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000441286  unclonable  0.00000859412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>