40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2044 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2044  cytochrome c, class I  100 
 
 		 111 aa  220  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.81366e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2183  cytochrome c, class I  81.82 
 
 		 110 aa  183  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0155  cytochrome c, class I  55.45 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0331  cytochrome c, class I  57.3 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2743  cytochrome c family protein  62.82 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0558  cytochrome c family protein  50 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.271459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2628  cytochrome c class I  51.22 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1585  cytochrome c class I  36.57 
 
 		 134 aa  86.7  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255347  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2432  cytochrome c family protein  41.1 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  28.85 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  28.71 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3495  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0899  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  31.73 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44056  cytochrome c6, cytochrome c553  32.05 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1425  cytochrome c, class I  37.97 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0879  cytochrome c class I  26.85 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  28.7 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  28.43 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  28.7 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18191  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  30.67 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2435  cytochrome c class I  37.97 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0915  cytochrome c6  31.17 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.133204  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3862  cytochrome c class I  28.57 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17581  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  34.15 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4618  cytochrome c, class I  29.33 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05781  hypothetical protein  27.27 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0993  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  32.05 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  26.42 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0716  cytochrome c  28.18 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.459655  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1014  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  27.83 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  24.75 
 
 		 110 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0239  cytochrome C6 soluble cytochrome f  27.85 
 
 		 112 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.783441 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0010  cytochrome c  26.85 
 
 		 123 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2522  cytochrome c class I  36.49 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2542  putative cytochrome C6-2  26.83 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0112262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  30.85 
 
 		 284 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3983  cytochrome c class I  30 
 
 		 111 aa  41.2  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06291  hypothetical protein  25.47 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>