32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47332 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_47332  predicted protein  100 
 
 		 154 aa  319  8e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0518797  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37509  predicted protein  47.44 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0501063  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  40.95 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0959  cytochrome c class I  41.11 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.809714  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  38.71 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  39.6 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44056  cytochrome c6, cytochrome c553  39.02 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  34.41 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17581  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  37.61 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2744  cytochrome c, class I  36.84 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3862  cytochrome c class I  42.31 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0239  cytochrome C6 soluble cytochrome f  34.02 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.783441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  35.23 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0879  cytochrome c class I  30.95 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2542  putative cytochrome C6-2  32.22 
 
 		 115 aa  51.2  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0112262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3983  cytochrome c class I  32.93 
 
 		 111 aa  48.5  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18191  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  31.19 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4618  cytochrome c, class I  28.92 
 
 		 111 aa  47.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0558  cytochrome c family protein  31.25 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.271459  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  28.92 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  28.92 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3495  cytochrome c class I  32.53 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  30.3 
 
 		 278 aa  44.7  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1014  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  28.57 
 
 		 128 aa  43.9  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2628  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1585  cytochrome c class I  32.05 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255347  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2743  cytochrome c family protein  30.77 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2352  cytochrome c class I  27.27 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0915  cytochrome c6  29.07 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.133204  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2504  putative cytochrome c  28.26 
 
 		 434 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.347672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>