133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_44056 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_44056  cytochrome c6, cytochrome c553  100 
 
 		 133 aa  260  4e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3862  cytochrome c class I  66.67 
 
 		 111 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  56.38 
 
 		 111 aa  114  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  59.14 
 
 		 111 aa  113  6.9999999999999995e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  55.1 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2744  cytochrome c, class I  54.26 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  56.12 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  56.12 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0959  cytochrome c class I  51.61 
 
 		 125 aa  104  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.809714  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  53.26 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0239  cytochrome C6 soluble cytochrome f  52.58 
 
 		 112 aa  97.1  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.783441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  51.06 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17581  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  51 
 
 		 115 aa  93.6  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1014  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  45.37 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3983  cytochrome c class I  51.25 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0915  cytochrome c6  50 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.133204  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0879  cytochrome c class I  46.67 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  41.67 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  41.67 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2542  putative cytochrome C6-2  47.31 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0112262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47332  predicted protein  35.64 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0518797  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3495  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4618  cytochrome c, class I  38.3 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0558  cytochrome c family protein  38.67 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.271459  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0632  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  41.77 
 
 		 311 aa  54.3  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  34.38 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2183  cytochrome c, class I  35.14 
 
 		 110 aa  52  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4116  cytochrome c class I  29.59 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115646 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2538  cytochrome c, class I  34.23 
 
 		 313 aa  50.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2628  cytochrome c class I  35 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1279  cytochrome C oxidase subunit III  32.09 
 
 		 326 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.55862 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0341  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  40.22 
 
 		 306 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0261936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2346  cytochrome c class I  36.71 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0683  cytochrome c class I  31.33 
 
 		 381 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2513  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1280  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  39.51 
 
 		 296 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1877  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.5 
 
 		 325 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.020094  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5018  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  39.47 
 
 		 287 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2992  cytochrome c class I  35.44 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169382  normal  0.0463014 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1585  cytochrome c class I  33.75 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255347  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2743  cytochrome c family protein  31.71 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1963  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.33 
 
 		 299 aa  47.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0716  cytochrome c  31.87 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.459655  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1200  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.23 
 
 		 307 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0698  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2419  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  41.77 
 
 		 298 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.203271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0317  cytochrome c, class I  40.51 
 
 		 285 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00320646 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4959  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.09 
 
 		 287 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18191  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  30.53 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5923  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.44 
 
 		 293 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123388  normal  0.389873 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2044  cytochrome c, class I  32.05 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.81366e-16 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1107  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.28 
 
 		 307 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.1867  normal  0.890058 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 251 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0331  cytochrome c, class I  32.18 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5932  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.29 
 
 		 289 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322856  normal  0.495001 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6265  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.29 
 
 		 289 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.142904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4390  hypothetical protein  37.35 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0017  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.35 
 
 		 293 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3330  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  34.19 
 
 		 291 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4058  isoquinoline 1-oxidoreductase  30 
 
 		 1215 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.222777 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2687  cytochrome c-550  29.13 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526015  normal  0.0470117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2794  cytochrome-c oxidase fixP chain  34.83 
 
 		 290 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40028  normal  0.764362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0759  cytochrome c, class I  36 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.940622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07721  cytochrome c  29.67 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3273  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.14 
 
 		 293 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  40.26 
 
 		 308 aa  44.3  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3854  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  40 
 
 		 292 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2475  putative cytochrome C oxidase (subunit III) transmembrane protein  39.29 
 
 		 307 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.48971  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0250  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000296226  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1787  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.35 
 
 		 296 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.832372  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  34.48 
 
 		 351 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0043  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.79 
 
 		 575 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.33 
 
 		 287 aa  42.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3877  cytochrome c, class I  40.79 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0155  cytochrome c, class I  32.05 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  28.57 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1450  cytochrome c, class I  29.49 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  32.43 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6039  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  33.33 
 
 		 1179 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0887172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  38.24 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0376  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  30.33 
 
 		 287 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0214  cytochrome c class I  38.2 
 
 		 144 aa  42.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2070  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.64 
 
 		 317 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2140  cytochrome c, class I  32.53 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0189398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0809  cytochrome c, class I  34.57 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06291  hypothetical protein  31.33 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0097  cytochrome c class I  41.86 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.340864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2352  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2118  cytochrome c class I  35.56 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000343097  normal  0.41454 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1153  cytochrome c family protein  34.18 
 
 		 218 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0012  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.94 
 
 		 293 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0733  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.33 
 
 		 293 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  35.53 
 
 		 101 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2821  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.45 
 
 		 303 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106321  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1152  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34 
 
 		 307 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.67748  normal  0.0615842 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.96 
 
 		 312 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2440  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.33 
 
 		 288 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0996  cytochrome c class I  34.57 
 
 		 103 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4137  cytochrome c class I  35.11 
 
 		 320 aa  41.6  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2117  cytochrome c class I  32.61 
 
 		 141 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000139618  normal  0.419433 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>