23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2687 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2687  cytochrome c-550  100 
 
 
165 aa  341  2.9999999999999997e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526015  normal  0.0470117 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3863  cytochrome c-550  49.66 
 
 
165 aa  151  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.847125  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2010  cytochrome c-550  44.83 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3864  cytochrome c-550  30.38 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.878941  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4370  cytochrome c-550  28.57 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030096 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4309  cytochrome c-550  28.57 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05311  cytochrome c-550  31.58 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2746  cytochrome c-550  32.77 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2146  cytochrome c-550  35.14 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.851244  normal  0.117545 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0961  cytochrome c-550  38.67 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3109  cytochrome c-550  28.22 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0531  cytochrome c-550  36.59 
 
 
170 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0845307  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2686  cytochrome c, class I  31.58 
 
 
161 aa  61.2  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  28.57 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  28.87 
 
 
111 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  32.5 
 
 
111 aa  45.1  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  29.47 
 
 
111 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  29.47 
 
 
111 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44056  cytochrome c6, cytochrome c553  28.71 
 
 
133 aa  43.9  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0879  cytochrome c class I  26.32 
 
 
111 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0331  cytochrome c, class I  28.41 
 
 
120 aa  42  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0239  cytochrome C6 soluble cytochrome f  25 
 
 
112 aa  41.2  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.783441 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0915  cytochrome c6  32.73 
 
 
124 aa  40.4  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.133204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>