149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4116 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4116  cytochrome c class I  100 
 
 		 124 aa  250  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  39.39 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0959  cytochrome c class I  29.17 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.809714  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  32.67 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  35.63 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4216  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.14 
 
 		 434 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  35.19 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  30.84 
 
 		 296 aa  50.8  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4618  cytochrome c, class I  34.52 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0759  cytochrome c, class I  29.17 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.940622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17581  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  31.33 
 
 		 115 aa  50.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  31.91 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1798  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.55 
 
 		 292 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  27.68 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4957  Pyrrolo-quinoline quinone  35.9 
 
 		 698 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.897916 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  31.58 
 
 		 350 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  32.74 
 
 		 430 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  30.59 
 
 		 407 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1601  cytochrome c, class I  33.73 
 
 		 432 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.023048  normal  0.40449 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3996  cytochrome c, class I  32.74 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3250  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.14 
 
 		 422 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4297  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.73 
 
 		 441 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44056  cytochrome c6, cytochrome c553  29.41 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  28.38 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2650  hypothetical protein  34.44 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  26.79 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  33.73 
 
 		 439 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  38.1 
 
 		 503 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  35.62 
 
 		 385 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  34.02 
 
 		 395 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  31.94 
 
 		 385 aa  46.2  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  38.82 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4961  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.94 
 
 		 426 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360414  normal  0.0488597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0703  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2157  hypothetical protein  30.53 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.580825  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  34.74 
 
 		 388 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3175  cytochrome c, class I  32.53 
 
 		 432 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  34.07 
 
 		 394 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  34.07 
 
 		 393 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  34.07 
 
 		 394 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5193  cytochrome c, class I  32.53 
 
 		 432 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0462  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.33 
 
 		 294 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528353  normal  0.120204 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3887  cytochrome c class I  34.21 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389814 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  34.74 
 
 		 388 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 394 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5084  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.53 
 
 		 432 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0573  cytochrome c, class I  32.95 
 
 		 196 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0439994  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1779  cytochrome c, class I  28.75 
 
 		 214 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1673  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.36 
 
 		 307 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.528501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3959  cytochrome c, class I  31.33 
 
 		 434 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4408  cytochrome c, class I  31.33 
 
 		 434 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1391  cytochrome c, class I  30.61 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5949  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.33 
 
 		 434 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.275687  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2405  cytochrome c class I  32.31 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2794  cytochrome-c oxidase fixP chain  33.33 
 
 		 290 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40028  normal  0.764362 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14180  cytochrome c, mono- and diheme variants family  31.4 
 
 		 266 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.616928  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  34.67 
 
 		 382 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3264  c-type cytochrome  31.86 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  32.53 
 
 		 284 aa  44.3  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1529  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.36 
 
 		 296 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  34.07 
 
 		 393 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  30.61 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  30.61 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6799  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.07 
 
 		 454 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131117  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2435  cytochrome c class I  27.78 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  29.35 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2094  cytochrome c, class I  30.85 
 
 		 429 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.716571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5264  putative c-type cytochrome  34.69 
 
 		 415 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61130  putative c-type cytochrome  34.69 
 
 		 415 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00213286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  31.52 
 
 		 388 aa  43.5  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  29.67 
 
 		 394 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1425  cytochrome c, class I  27.78 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  31.52 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  26.53 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0986  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.47 
 
 		 430 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1845  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.15 
 
 		 349 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1415  cytochrome c class I  32.26 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  32.1 
 
 		 190 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2001  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.09 
 
 		 325 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1406  hypothetical protein  31.4 
 
 		 291 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2744  cytochrome c, class I  30.23 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  32.1 
 
 		 190 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0171  putative cytochrome c, class I  34.52 
 
 		 469 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  32.1 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1272  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.139813  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3248  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517083  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  29.03 
 
 		 427 aa  42  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0809  cytochrome c, class I  28.38 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3376  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  36.47 
 
 		 426 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  31.33 
 
 		 220 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0966  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  36.47 
 
 		 430 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1001  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  36.47 
 
 		 430 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3983  cytochrome c class I  30 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1153  cytochrome c family protein  25.97 
 
 		 218 aa  41.6  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  31.63 
 
 		 493 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  30.43 
 
 		 156 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3648  hypothetical protein  35.53 
 
 		 285 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.923752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3819  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.46 
 
 		 313 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3273  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.44 
 
 		 293 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0201  cytochrome c, class I  32.53 
 
 		 432 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>