39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2628 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2628  cytochrome c class I  100 
 
 		 138 aa  283  7e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1585  cytochrome c class I  86.23 
 
 		 134 aa  207  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255347  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2743  cytochrome c family protein  57.14 
 
 		 111 aa  100  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2183  cytochrome c, class I  50.5 
 
 		 110 aa  98.6  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0331  cytochrome c, class I  55.84 
 
 		 120 aa  95.9  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0558  cytochrome c family protein  32.89 
 
 		 150 aa  94  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.271459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2432  cytochrome c family protein  51.32 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0155  cytochrome c, class I  50.65 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2044  cytochrome c, class I  49.46 
 
 		 111 aa  90.1  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.81366e-16 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0899  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  38.64 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  30.34 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0993  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  36.59 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3495  cytochrome c class I  32.94 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  33.72 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  33.72 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0879  cytochrome c class I  33.78 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  28.92 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  28.92 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  27.2 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18191  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  35.53 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  34.94 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44056  cytochrome c6, cytochrome c553  35.44 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  31.03 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05781  hypothetical protein  39.66 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17581  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  33.73 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3862  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4618  cytochrome c, class I  26.19 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47332  predicted protein  32.94 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0518797  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0010  cytochrome c  32.35 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2744  cytochrome c, class I  29.89 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2542  putative cytochrome C6-2  29.55 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0112262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06291  hypothetical protein  30.88 
 
 		 123 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0239  cytochrome C6 soluble cytochrome f  30.49 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.783441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0959  cytochrome c class I  28.74 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.809714  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0915  cytochrome c6  51.61 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.133204  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1014  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  44.44 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3724  cytochrome c-551  25.76 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  26.85 
 
 		 154 aa  40.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6090  cytochrome c class I  29.06 
 
 		 446 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>