38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1585 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1585  cytochrome c class I  100 
 
 		 134 aa  273  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2628  cytochrome c class I  77.54 
 
 		 138 aa  204  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2743  cytochrome c family protein  57.14 
 
 		 111 aa  97.8  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2432  cytochrome c family protein  51.32 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2183  cytochrome c, class I  40.6 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0331  cytochrome c, class I  54.55 
 
 		 120 aa  90.5  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0558  cytochrome c family protein  33.97 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.271459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2044  cytochrome c, class I  50.59 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.81366e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0155  cytochrome c, class I  48.05 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3495  cytochrome c class I  37.35 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0899  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  38.64 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  31.33 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  30.12 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  30.12 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0993  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  34.15 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0879  cytochrome c class I  31.08 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  32.14 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  32.14 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  33.73 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05781  hypothetical protein  36.23 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17581  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  32.22 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44056  cytochrome c6, cytochrome c553  33.33 
 
 		 133 aa  48.1  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4618  cytochrome c, class I  26.19 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18191  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  35.59 
 
 		 125 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2542  putative cytochrome C6-2  30.61 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0112262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  31.4 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0010  cytochrome c  30 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  28.74 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06291  hypothetical protein  28.89 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0239  cytochrome C6 soluble cytochrome f  29.07 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.783441 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47332  predicted protein  32.61 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0518797  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3862  cytochrome c class I  30.56 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2744  cytochrome c, class I  45 
 
 		 121 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0959  cytochrome c class I  32.05 
 
 		 125 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.809714  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3648  cytochrome c class I  31.85 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1014  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  44.68 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  28.92 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  39.74 
 
 		 393 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>