39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2743 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2743  cytochrome c family protein  100 
 
 		 111 aa  226  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0155  cytochrome c, class I  64.1 
 
 		 110 aa  117  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2044  cytochrome c, class I  62.82 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.81366e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0331  cytochrome c, class I  54.02 
 
 		 120 aa  104  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2183  cytochrome c, class I  49.53 
 
 		 110 aa  102  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2628  cytochrome c class I  57.14 
 
 		 138 aa  100  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0558  cytochrome c family protein  55.13 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.271459  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1585  cytochrome c class I  57.14 
 
 		 134 aa  98.6  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255347  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2432  cytochrome c family protein  46.67 
 
 		 104 aa  84.3  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  36.71 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  36.71 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0993  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  33.7 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4618  cytochrome c, class I  35.44 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  34.58 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3495  cytochrome c class I  37.33 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18191  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  35.06 
 
 		 125 aa  50.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0899  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  38.67 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0239  cytochrome C6 soluble cytochrome f  33.33 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.783441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0879  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 111 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  35.9 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  28.44 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  35.9 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  34.62 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17581  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  31.43 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44056  cytochrome c6, cytochrome c553  31.71 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0010  cytochrome c  34.67 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  27.45 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05781  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0915  cytochrome c6  31.48 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.133204  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1425  cytochrome c, class I  36.99 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06291  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47332  predicted protein  30.77 
 
 		 154 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0518797  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  29.49 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05311  cytochrome c-550  28.43 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3107  cytochrome c, class I  32.1 
 
 		 305 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510771  normal  0.352992 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1014  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  40.54 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3862  cytochrome c class I  28.77 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2435  cytochrome c class I  35.62 
 
 		 97 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2542  putative cytochrome C6-2  30.67 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0112262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>