39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_06291 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_06291  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  254  2e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0010  cytochrome c  95.12 
 
 
123 aa  240  5e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18191  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  63.64 
 
 
125 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0661236 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05781  hypothetical protein  60.22 
 
 
128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0899  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  59.14 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0993  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  61.63 
 
 
104 aa  110  5e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  41.67 
 
 
111 aa  91.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2542  putative cytochrome C6-2  43.12 
 
 
115 aa  87  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0112262  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3495  cytochrome c class I  39.81 
 
 
104 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07721  cytochrome c  36.07 
 
 
117 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  45.45 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  45.45 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0716  cytochrome c  39.33 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.459655  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0879  cytochrome c class I  46.43 
 
 
111 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4618  cytochrome c, class I  45.35 
 
 
111 aa  77.8  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1014  cytochrome c6 (soluble cytochrome f) (cytochrome c553)  32.14 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156053  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0239  cytochrome C6 soluble cytochrome f  32.61 
 
 
112 aa  62.8  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.783441 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0915  cytochrome c6  33 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.133204  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3862  cytochrome c class I  33.65 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  32.14 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  28.43 
 
 
111 aa  57.8  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2744  cytochrome c, class I  34.44 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  32.14 
 
 
110 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  29.63 
 
 
111 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  29.63 
 
 
111 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  31.78 
 
 
131 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0959  cytochrome c class I  31.11 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.809714  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3983  cytochrome c class I  30 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17581  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  29.2 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0558  cytochrome c family protein  36.14 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.271459  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0155  cytochrome c, class I  29.33 
 
 
110 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0331  cytochrome c, class I  30.38 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2628  cytochrome c class I  30.88 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44056  cytochrome c6, cytochrome c553  31.33 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2183  cytochrome c, class I  29.49 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1585  cytochrome c class I  31.25 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255347  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2743  cytochrome c family protein  33.33 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1762  Cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  42.22 
 
 
585 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2044  cytochrome c, class I  28.89 
 
 
111 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.81366e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>