14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_05311 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_05311  cytochrome c-550  100 
 
 		 170 aa  350  7e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2146  cytochrome c-550  64.12 
 
 		 186 aa  241  3.9999999999999997e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.851244  normal  0.117545 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0531  cytochrome c-550  61.18 
 
 		 170 aa  231  3e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0845307  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2746  cytochrome c-550  47.83 
 
 		 163 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3864  cytochrome c-550  48.41 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.878941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0961  cytochrome c-550  50.71 
 
 		 163 aa  155  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2010  cytochrome c-550  47.86 
 
 		 215 aa  145  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2686  cytochrome c, class I  42.77 
 
 		 161 aa  140  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3109  cytochrome c-550  43.62 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4309  cytochrome c-550  39.16 
 
 		 160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4370  cytochrome c-550  39.16 
 
 		 160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030096 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2687  cytochrome c-550  31.58 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526015  normal  0.0470117 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3863  cytochrome c-550  33.33 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.847125  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2743  cytochrome c family protein  28.43 
 
 		 111 aa  40.8  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>