239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2522 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2522  cytochrome c class I  100 
 
 
97 aa  183  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2435  cytochrome c class I  98.97 
 
 
97 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1425  cytochrome c, class I  94.85 
 
 
97 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2405  cytochrome c class I  63 
 
 
100 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0759  cytochrome c, class I  53.92 
 
 
100 aa  89  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.940622  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  46.32 
 
 
101 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3841  cytochrome c variant  37.5 
 
 
230 aa  67  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  40.62 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2650  hypothetical protein  41.38 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  32.97 
 
 
284 aa  60.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  39.33 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  41.11 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3495  cytochrome c class I  35.56 
 
 
104 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1826  cytochrome c, class I  38.27 
 
 
251 aa  53.5  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.384457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3829  cytochrome c, class I  40.21 
 
 
99 aa  52.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.82757  normal  0.284345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4618  cytochrome c, class I  37.18 
 
 
111 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1280  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  40.24 
 
 
296 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0693  Cbb3-type cytochrome c oxidase CcoP subunit  34.52 
 
 
290 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2348  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.52 
 
 
290 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.765339  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1787  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  42.55 
 
 
296 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.832372  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  32.63 
 
 
177 aa  52  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003470  cytochrome c oxidase subunit CcoP  45.59 
 
 
324 aa  51.2  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.204703  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  35.29 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3273  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.71 
 
 
293 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1845  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  39.02 
 
 
349 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2794  cytochrome-c oxidase fixP chain  36.36 
 
 
290 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40028  normal  0.764362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0879  cytochrome c class I  31.11 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3983  cytochrome c class I  39.22 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0703  cytochrome c class I  40.54 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02300  hypothetical protein  45.59 
 
 
324 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0915  cytochrome c6  32.98 
 
 
124 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.133204  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0012  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.66 
 
 
293 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0537  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.1 
 
 
292 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.931468  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  32.22 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  35.11 
 
 
390 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  34.04 
 
 
503 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1566  diheme cytochrome c  44.12 
 
 
324 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  30.14 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2044  cytochrome c, class I  37.23 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.81366e-16 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  33.33 
 
 
329 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0809  cytochrome c, class I  34.21 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1406  hypothetical protein  31.87 
 
 
291 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0017  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.16 
 
 
293 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2138  cytochrome c family protein  31 
 
 
104 aa  47.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.203882 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2244  cytochrome c class I  31 
 
 
104 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3862  cytochrome c class I  36.23 
 
 
111 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2134  cytochrome c family protein  31 
 
 
103 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4116  cytochrome c class I  30.34 
 
 
124 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115646 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2356  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.73 
 
 
498 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0634  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  40.51 
 
 
304 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2114  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.88 
 
 
293 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5233  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.88 
 
 
293 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558245  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  36.67 
 
 
528 aa  47  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  29.21 
 
 
504 aa  47  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  37.66 
 
 
385 aa  47.4  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2157  hypothetical protein  31.46 
 
 
171 aa  47  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.580825  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.89 
 
 
308 aa  47  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.92 
 
 
312 aa  47  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.18 
 
 
287 aa  46.2  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1153  cytochrome c family protein  31.17 
 
 
218 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0959  cytochrome c class I  29.79 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.809714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  30 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5965  putative cytochrome c like protein  31.91 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2542  putative cytochrome C6-2  33.33 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0112262  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1050  cytochrome c oxidase, subunit CcoP  39.02 
 
 
326 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.26248  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  34.52 
 
 
538 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  33.33 
 
 
493 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  35.53 
 
 
385 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3780  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  36.9 
 
 
318 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44400  putative cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.9 
 
 
318 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0376  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  37.18 
 
 
287 aa  46.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  36.71 
 
 
544 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1587  hypothetical protein  31.87 
 
 
291 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02058  Cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  43.04 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00379379  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2294  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  32.29 
 
 
453 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  33.33 
 
 
566 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3823  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.12 
 
 
325 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85561  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0733  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.06 
 
 
293 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1779  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
214 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2041  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  36.59 
 
 
304 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112855  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2440  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.9 
 
 
288 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132686  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  33.33 
 
 
542 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4957  Pyrrolo-quinoline quinone  36.84 
 
 
698 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.897916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  32.05 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0775  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  33.33 
 
 
374 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0709529  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2744  cytochrome c, class I  34.07 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal  0.40097 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  32.05 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0466  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.46 
 
 
287 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00151581  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  35.29 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
557 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  35.29 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  30 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1294  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
527 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0963416  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.49 
 
 
298 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.168664  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6536  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
527 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1610  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.94 
 
 
325 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00269268  hitchhiker  0.0066634 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1087  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  42.86 
 
 
304 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497321  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1529  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.14 
 
 
296 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2419  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.93 
 
 
298 aa  44.3  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.203271  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0781  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.94 
 
 
382 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.279912  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>