91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3705 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  322  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  30.2 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  37.35 
 
 		 379 aa  70.9  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0070  putative cytochrome c class I protein  29.11 
 
 		 199 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.327353 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  29.53 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2582  cytochrome c family protein  29.66 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.423812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2733  putative cytochrome c class I protein  34.12 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  32.97 
 
 		 382 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2431  cytochrome c family protein  35.71 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1034  cytochrome c family protein  29.38 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2349  cytochrome c family protein  29.01 
 
 		 203 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3238  cytochrome c family protein  31.43 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3254  cytochrome c family protein  28.95 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00276753  normal  0.22329 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  39.02 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4349  hypothetical protein  26.21 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00411477  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  30.91 
 
 		 293 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0699  putative cytochrome c heme-binding site  24 
 
 		 206 aa  57  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.517675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2260  cytochrome c family protein  26.47 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0115  class I triheme cytochrome c  28.45 
 
 		 414 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1751  cytochrome c, class I  28.45 
 
 		 414 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.399641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  27 
 
 		 373 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5183  hypothetical protein  32.26 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.488725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4637  cytochrome c family protein  26.37 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0809  cytochrome c, class I  34.74 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2216  hypothetical protein  30.43 
 
 		 280 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0103388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  29 
 
 		 394 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  29.29 
 
 		 394 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1944  cytochrome c family protein  22.22 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.731433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4137  cytochrome c class I  35 
 
 		 320 aa  53.9  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  31 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0012  hypothetical protein  30.08 
 
 		 259 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  28.97 
 
 		 393 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  29.55 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0012  hypothetical protein  30.08 
 
 		 259 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00152661  normal  0.126895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0014  hypothetical protein  30.08 
 
 		 259 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0801352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0708  hypothetical protein  22.97 
 
 		 197 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295547 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  29 
 
 		 394 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  29 
 
 		 394 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1593  cytochrome c heme-binding site  28.57 
 
 		 212 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  30.53 
 
 		 388 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  30.53 
 
 		 388 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4387  cytochrome c family protein  25.27 
 
 		 206 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  28 
 
 		 393 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  28.42 
 
 		 393 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  32.95 
 
 		 878 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0148  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 248 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0759  cytochrome c, class I  33.72 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.940622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  31.96 
 
 		 395 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  31.43 
 
 		 683 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  33.71 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  28.72 
 
 		 388 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5378  cytochrome c family protein  29.67 
 
 		 260 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  29.89 
 
 		 546 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0097  hypothetical protein  30 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000663376 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  31.11 
 
 		 633 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  28.15 
 
 		 653 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  36.59 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  28.43 
 
 		 702 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  28.43 
 
 		 702 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  30.85 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0572  hypothetical protein  28.92 
 
 		 257 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  28.42 
 
 		 647 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0990  cytochrome c, class I  30.34 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  28.24 
 
 		 194 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  31.33 
 
 		 254 aa  44.3  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  28.42 
 
 		 636 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  29.27 
 
 		 193 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  28 
 
 		 254 aa  43.9  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2435  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  28.42 
 
 		 647 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  29.55 
 
 		 652 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4116  cytochrome c class I  31.52 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115646 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0116  hypothetical protein  30.49 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  25.83 
 
 		 314 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  30.23 
 
 		 632 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2522  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  24.35 
 
 		 296 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  25.53 
 
 		 631 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  28.26 
 
 		 220 aa  42  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1583  cytochrome c class I  31.82 
 
 		 152 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.889837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1425  cytochrome c, class I  30 
 
 		 97 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2585  cytochrome c class I  28.4 
 
 		 112 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  27.78 
 
 		 664 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  29.09 
 
 		 644 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1153  cytochrome c family protein  30.95 
 
 		 218 aa  41.6  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  31.43 
 
 		 499 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5620  cytochrome c, mono-and diheme variant-like protein  28.28 
 
 		 398 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0101  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  26.67 
 
 		 329 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000967148 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  28.09 
 
 		 629 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0120  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  27.78 
 
 		 339 aa  40.8  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  29.67 
 
 		 209 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>