71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2102 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2102  cytochrome c, class I  100 
 
 		 268 aa  518  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.895116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0656  cytochrome c, class I  50 
 
 		 283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0018  cytochrome c, class I  47.13 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1478  cytochrome CytM  39.77 
 
 		 145 aa  55.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.611234 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  37.21 
 
 		 125 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  26.46 
 
 		 370 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3662  cytochrome c class I  36.47 
 
 		 124 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3942  cytochrome c class I  32.56 
 
 		 109 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.914915 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  36.45 
 
 		 152 aa  50.4  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  28.16 
 
 		 367 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2103  cytochrome c class I  36.47 
 
 		 124 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2147  cytochrome c class I  36.47 
 
 		 124 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.620434 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2140  cytochrome c class I  37.21 
 
 		 124 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.986487  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  34.94 
 
 		 678 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4020  cytochrome c, class I  35.56 
 
 		 124 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442148  normal  0.970341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  35.44 
 
 		 503 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1601  cytochrome c, class I  38.68 
 
 		 125 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4272  hypothetical protein  31.09 
 
 		 545 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  40.62 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  31.31 
 
 		 561 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2099  cytochrome c, class I  36.04 
 
 		 123 aa  46.2  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0695  cytochrome c  34.12 
 
 		 129 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0683  cytochrome c class I  32.61 
 
 		 381 aa  45.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2430  cytochrome c, class I  35.56 
 
 		 301 aa  45.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15291  cytochrome cM  34.12 
 
 		 129 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.427205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.79 
 
 		 444 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42120  hypothetical protein  31.18 
 
 		 273 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0720  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.7 
 
 		 427 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.690125 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2784  diheme class I cytochrome c  31.82 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.7 
 
 		 427 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310202  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2426  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (xoxG)  38.57 
 
 		 139 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00658149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0632  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  40 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  41.94 
 
 		 352 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1809  cytochrome c class I  29.73 
 
 		 153 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4312  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.8 
 
 		 420 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3640  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.66 
 
 		 395 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1529  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.21 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3471  cytochrome c, class I  35.58 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0593  hypothetical protein  36.73 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1543  cytochrome c, class I  34.45 
 
 		 419 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303209  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3156  cytochrome c, class I  36.19 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  31.39 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  26.83 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4096  putative cytochrome c  33.9 
 
 		 447 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1152  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.56 
 
 		 307 aa  43.5  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.67748  normal  0.0615842 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3851  cytochrome c, class I  36.17 
 
 		 420 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.585006  normal  0.540211 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1491  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 109 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2525  hypothetical protein  38.36 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2986  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.73 
 
 		 447 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0943  cytochrome c family protein  35.96 
 
 		 650 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0780  cytochrome c family protein  35.96 
 
 		 476 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00190536  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0772  putative oxidoreductase dehydrogenase (cytochrome C subunit) signal peptide protein  35.48 
 
 		 429 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.456552  hitchhiker  0.00960965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  64 
 
 		 530 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1140  cytochrome c, mono- and diheme variant  30.59 
 
 		 269 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000421025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0717  cytochrome cM  35.29 
 
 		 129 aa  43.5  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1781  cytochrome c, class I  32.18 
 
 		 451 aa  43.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0339245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3107  hypothetical protein  36.99 
 
 		 127 aa  43.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  26.92 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  26.92 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2346  cytochrome c class I  31.91 
 
 		 187 aa  43.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3572  hypothetical protein  30.11 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  34.15 
 
 		 557 aa  43.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  26.92 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  29.29 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2628  cytochrome c, putative  41.11 
 
 		 551 aa  43.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  55.56 
 
 		 329 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  62.96 
 
 		 330 aa  42.7  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3392  glucose sorbosone dehydrogenase  48.65 
 
 		 476 aa  42.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428431  normal  0.278741 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  35.23 
 
 		 130 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1151  cytochrome c alcohol dehydrogenase subunit  30.23 
 
 		 451 aa  42.4  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>