56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5010 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3323  cytochrome c, class I:cytochrome d1, heme region  72.74 
 
 		 576 aa  805    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000018049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3172  cytochrome d1, heme region  89.91 
 
 		 549 aa  1033    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06750  nitrite reductase precursor  66.36 
 
 		 568 aa  778    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0077  nitrite reductase (NO-forming)  72.29 
 
 		 575 aa  801    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.459085 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2618  Nitrite reductase (NO-forming)  58.05 
 
 		 560 aa  640    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0412143  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2487  hydroxylamine reductase  63.41 
 
 		 596 aa  708    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.756283 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3125  hydroxylamine reductase  70.93 
 
 		 574 aa  789    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.74527  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5010  hydroxylamine reductase  100 
 
 		 567 aa  1167    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824886  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3274  cytochrome d1, heme region  61.79 
 
 		 561 aa  661    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1912  nitrite reductase (NO-forming)  71.48 
 
 		 574 aa  803    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0620  nitrite reductase precursor  68.41 
 
 		 568 aa  775    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3180  nitrite reductase precursor  64.42 
 
 		 583 aa  711    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.795013  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1717  Hydroxylamine reductase  71.48 
 
 		 574 aa  803    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1442  hydroxylamine reductase  68.76 
 
 		 573 aa  782    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0462  Hydroxylamine reductase  54.37 
 
 		 553 aa  567  1e-160  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000301578  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3430  hydroxylamine reductase  53.22 
 
 		 690 aa  552  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133713  decreased coverage  0.000818462 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0339  Hydroxylamine reductase  52.77 
 
 		 548 aa  549  1e-155  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000373839  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0652  Nitrite reductase (NO-forming)  50.28 
 
 		 565 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4220  nitrite reductase  44.49 
 
 		 542 aa  428  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0434848  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0070  nitrite reductase (NO-forming)  25.82 
 
 		 517 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.532245  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  27.75 
 
 		 546 aa  147  5e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  26.36 
 
 		 493 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  24.14 
 
 		 542 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  25.85 
 
 		 504 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  26.68 
 
 		 503 aa  140  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  25.5 
 
 		 493 aa  139  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  27.67 
 
 		 542 aa  135  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  27.37 
 
 		 566 aa  134  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06650  putative c-type cytochrome  26.16 
 
 		 493 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  27.19 
 
 		 525 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2495  cytochrome d1, heme region  26.1 
 
 		 484 aa  121  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  25.33 
 
 		 517 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2608  cytochrome d1 heme region  24.86 
 
 		 547 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213874  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  24.67 
 
 		 519 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  26.6 
 
 		 528 aa  115  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3029  cytochrome d1 heme subunit  26.55 
 
 		 527 aa  110  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  21.5 
 
 		 556 aa  94.4  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  22.69 
 
 		 557 aa  88.2  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0591  cytochrome d1, heme region  25.23 
 
 		 538 aa  77  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1921  cytochrome d1, heme region  23.28 
 
 		 541 aa  75.1  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2080  cytochrome d1, heme region  23.74 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79845  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0617  heme d1 biosynthesis protein NirF  24.08 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06720  heme d1 biosynthesis protein NirF  25.31 
 
 		 392 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.729227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4223  nirF protein  20.83 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3123  cytochrome d1, heme region  22.22 
 
 		 400 aa  49.3  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475371  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  29.7 
 
 		 143 aa  47.8  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0076  hypothetical protein  31.4 
 
 		 98 aa  46.6  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5013  cytochrome d1, heme region  21.58 
 
 		 413 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1140  cytochrome c, mono- and diheme variant  29.31 
 
 		 269 aa  45.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000421025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  34.88 
 
 		 350 aa  45.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  29.63 
 
 		 304 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  29.63 
 
 		 304 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1913  hypothetical protein  32.39 
 
 		 154 aa  44.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000530569  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  29.63 
 
 		 304 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2513  cytochrome c family protein  30.36 
 
 		 146 aa  43.9  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.66 
 
 		 313 aa  43.5  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>