73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3430 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3430  hydroxylamine reductase  100 
 
 		 690 aa  1418    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133713  decreased coverage  0.000818462 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0077  nitrite reductase (NO-forming)  53.62 
 
 		 575 aa  585  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.459085 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0462  Hydroxylamine reductase  54.25 
 
 		 553 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000301578  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3125  hydroxylamine reductase  54.34 
 
 		 574 aa  572  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.74527  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3323  cytochrome c, class I:cytochrome d1, heme region  53.35 
 
 		 576 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000018049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0620  nitrite reductase precursor  52.47 
 
 		 568 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2487  hydroxylamine reductase  52.35 
 
 		 596 aa  558  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.756283 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06750  nitrite reductase precursor  51.57 
 
 		 568 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1912  nitrite reductase (NO-forming)  51.05 
 
 		 574 aa  555  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1717  Hydroxylamine reductase  51.05 
 
 		 574 aa  555  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1442  hydroxylamine reductase  51.5 
 
 		 573 aa  557  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5010  hydroxylamine reductase  53.22 
 
 		 567 aa  552  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824886  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0339  Hydroxylamine reductase  50.65 
 
 		 548 aa  550  1e-155  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000373839  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3172  cytochrome d1, heme region  51.08 
 
 		 549 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0652  Nitrite reductase (NO-forming)  54.73 
 
 		 565 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2618  Nitrite reductase (NO-forming)  49.64 
 
 		 560 aa  536  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0412143  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3274  cytochrome d1, heme region  50.82 
 
 		 561 aa  525  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3180  nitrite reductase precursor  48.57 
 
 		 583 aa  524  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.795013  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4220  nitrite reductase  43.53 
 
 		 542 aa  444  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0434848  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  28.43 
 
 		 503 aa  163  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  30.81 
 
 		 546 aa  162  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  25.7 
 
 		 504 aa  159  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2495  cytochrome d1, heme region  27.74 
 
 		 484 aa  157  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  28.88 
 
 		 493 aa  154  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0070  nitrite reductase (NO-forming)  25.73 
 
 		 517 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.532245  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  25.65 
 
 		 493 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  26.65 
 
 		 542 aa  147  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  26.65 
 
 		 566 aa  147  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  24.45 
 
 		 542 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06650  putative c-type cytochrome  25.45 
 
 		 493 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  25.79 
 
 		 528 aa  140  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  25.93 
 
 		 525 aa  140  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  25.14 
 
 		 517 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2608  cytochrome d1 heme region  24.91 
 
 		 547 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3029  cytochrome d1 heme subunit  27.1 
 
 		 527 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  25.6 
 
 		 519 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  22.71 
 
 		 556 aa  106  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  21.82 
 
 		 557 aa  86.3  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2080  cytochrome d1, heme region  24.87 
 
 		 390 aa  76.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79845  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  38.79 
 
 		 277 aa  72.8  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3123  cytochrome d1, heme region  23.28 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475371  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5013  cytochrome d1, heme region  24.32 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1921  cytochrome d1, heme region  21.38 
 
 		 541 aa  68.9  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4223  nirF protein  22.83 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0617  heme d1 biosynthesis protein NirF  23.17 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0591  cytochrome d1, heme region  22.83 
 
 		 538 aa  67  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06720  heme d1 biosynthesis protein NirF  23.17 
 
 		 392 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.729227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1910  cytochrome d1, heme region  25.12 
 
 		 404 aa  66.6  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1715  cytochrome d1 heme region  25.12 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.792941  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0075  heme d1 biosynthesis protein NirF  21.92 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.61983 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3270  cytochrome d1, heme region  22.42 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3177  cytochrome cd1  23.91 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.976412 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2613  cytochrome d1 heme region  23.35 
 
 		 402 aa  55.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683986  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1256  cytochrome c, class I  30.3 
 
 		 272 aa  54.7  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2490  cytochrome d1, heme region  22.97 
 
 		 384 aa  54.3  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3436  cytochrome c, class I  34.38 
 
 		 290 aa  51.2  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.441606  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  27.38 
 
 		 399 aa  50.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2768  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 290 aa  50.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.712603  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0014  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.86 
 
 		 293 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0733  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.86 
 
 		 293 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  36.28 
 
 		 382 aa  47.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  36.28 
 
 		 382 aa  47.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  35.29 
 
 		 324 aa  47.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  32.64 
 
 		 388 aa  47  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  34.31 
 
 		 324 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0683  cytochrome c class I  32.26 
 
 		 381 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 		 370 aa  45.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  30.17 
 
 		 330 aa  44.3  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  31.19 
 
 		 330 aa  44.3  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  31.31 
 
 		 367 aa  43.9  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  34.82 
 
 		 337 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2538  cytochrome c, class I  29.01 
 
 		 313 aa  43.9  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  34.82 
 
 		 337 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>