44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1717 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2618  Nitrite reductase (NO-forming)  59.96 
 
 		 560 aa  667    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0412143  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2487  hydroxylamine reductase  61.57 
 
 		 596 aa  687    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.756283 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06750  nitrite reductase precursor  65.51 
 
 		 568 aa  781    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3180  nitrite reductase precursor  60.34 
 
 		 583 aa  716    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.795013  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1442  hydroxylamine reductase  83.62 
 
 		 573 aa  999    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3172  cytochrome d1, heme region  72.85 
 
 		 549 aa  800    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1912  nitrite reductase (NO-forming)  100 
 
 		 574 aa  1184    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0077  nitrite reductase (NO-forming)  66.38 
 
 		 575 aa  795    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.459085 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1717  Hydroxylamine reductase  100 
 
 		 574 aa  1184    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3125  hydroxylamine reductase  64.98 
 
 		 574 aa  788    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.74527  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5010  hydroxylamine reductase  71.48 
 
 		 567 aa  803    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824886  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3323  cytochrome c, class I:cytochrome d1, heme region  70.72 
 
 		 576 aa  815    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000018049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3274  cytochrome d1, heme region  59.96 
 
 		 561 aa  666    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0620  nitrite reductase precursor  67.57 
 
 		 568 aa  778    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0462  Hydroxylamine reductase  53.22 
 
 		 553 aa  558  1e-158  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000301578  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3430  hydroxylamine reductase  51.05 
 
 		 690 aa  555  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133713  decreased coverage  0.000818462 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0339  Hydroxylamine reductase  44.83 
 
 		 548 aa  507  9.999999999999999e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000373839  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0652  Nitrite reductase (NO-forming)  48.78 
 
 		 565 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4220  nitrite reductase  41.74 
 
 		 542 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0434848  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  28.57 
 
 		 546 aa  131  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  24.8 
 
 		 503 aa  128  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  23.97 
 
 		 504 aa  126  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  27.2 
 
 		 493 aa  125  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  24.01 
 
 		 493 aa  123  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  23.77 
 
 		 542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2495  cytochrome d1, heme region  25.4 
 
 		 484 aa  119  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  25.14 
 
 		 519 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06650  putative c-type cytochrome  23.8 
 
 		 493 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  25.46 
 
 		 566 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  25.46 
 
 		 542 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0070  nitrite reductase (NO-forming)  23.52 
 
 		 517 aa  107  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.532245  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3029  cytochrome d1 heme subunit  25 
 
 		 527 aa  107  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  24.29 
 
 		 528 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  23 
 
 		 517 aa  99  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  24.2 
 
 		 525 aa  98.2  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  21.96 
 
 		 556 aa  92.4  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2608  cytochrome d1 heme region  23.65 
 
 		 547 aa  91.3  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213874  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  22.14 
 
 		 557 aa  85.1  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1921  cytochrome d1, heme region  23.66 
 
 		 541 aa  73.6  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0591  cytochrome d1, heme region  23.41 
 
 		 538 aa  72.4  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  35.29 
 
 		 350 aa  48.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06720  heme d1 biosynthesis protein NirF  23.06 
 
 		 392 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.729227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0617  heme d1 biosynthesis protein NirF  22.57 
 
 		 392 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  29.01 
 
 		 143 aa  44.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>