57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2618 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0620  nitrite reductase precursor  57.65 
 
 		 568 aa  640    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3172  cytochrome d1, heme region  57.39 
 
 		 549 aa  651    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06750  nitrite reductase precursor  57.65 
 
 		 568 aa  641    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0077  nitrite reductase (NO-forming)  58.66 
 
 		 575 aa  656    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.459085 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2618  Nitrite reductase (NO-forming)  100 
 
 		 560 aa  1153    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0412143  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5010  hydroxylamine reductase  58.05 
 
 		 567 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824886  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3323  cytochrome c, class I:cytochrome d1, heme region  58.96 
 
 		 576 aa  644    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000018049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3274  cytochrome d1, heme region  72.11 
 
 		 561 aa  853    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1717  Hydroxylamine reductase  59.96 
 
 		 574 aa  667    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1912  nitrite reductase (NO-forming)  59.96 
 
 		 574 aa  667    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1442  hydroxylamine reductase  57.06 
 
 		 573 aa  633  1e-180  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3125  hydroxylamine reductase  56.53 
 
 		 574 aa  619  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.74527  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2487  hydroxylamine reductase  53.79 
 
 		 596 aa  590  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.756283 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3180  nitrite reductase precursor  53.8 
 
 		 583 aa  586  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.795013  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0462  Hydroxylamine reductase  52.2 
 
 		 553 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000301578  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3430  hydroxylamine reductase  49.64 
 
 		 690 aa  536  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133713  decreased coverage  0.000818462 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0652  Nitrite reductase (NO-forming)  50.27 
 
 		 565 aa  499  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0339  Hydroxylamine reductase  45.22 
 
 		 548 aa  480  1e-134  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000373839  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4220  nitrite reductase  44.01 
 
 		 542 aa  438  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0434848  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  27.62 
 
 		 546 aa  150  8e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  24.87 
 
 		 542 aa  134  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2495  cytochrome d1, heme region  25.48 
 
 		 484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  22.56 
 
 		 504 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0070  nitrite reductase (NO-forming)  24.02 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.532245  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  23.81 
 
 		 493 aa  116  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  21.46 
 
 		 493 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  24.81 
 
 		 519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  23.56 
 
 		 503 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3029  cytochrome d1 heme subunit  24.5 
 
 		 527 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  24.32 
 
 		 517 aa  109  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06650  putative c-type cytochrome  20.92 
 
 		 493 aa  107  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  23.84 
 
 		 525 aa  104  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  24.61 
 
 		 542 aa  103  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  24.31 
 
 		 566 aa  103  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  23.95 
 
 		 528 aa  101  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2608  cytochrome d1 heme region  22.83 
 
 		 547 aa  97.1  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213874  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  21.29 
 
 		 556 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  20.5 
 
 		 557 aa  70.9  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0591  cytochrome d1, heme region  24.5 
 
 		 538 aa  63.5  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1921  cytochrome d1, heme region  22.18 
 
 		 541 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2080  cytochrome d1, heme region  22 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79845  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3123  cytochrome d1, heme region  21.57 
 
 		 400 aa  53.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06720  heme d1 biosynthesis protein NirF  22.25 
 
 		 392 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.729227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0617  heme d1 biosynthesis protein NirF  22.01 
 
 		 392 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1140  cytochrome c, mono- and diheme variant  30.69 
 
 		 269 aa  48.5  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000421025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3236  hypothetical protein  26.39 
 
 		 182 aa  47.4  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4223  nirF protein  21.36 
 
 		 413 aa  46.6  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0189  putative cytochrome c class I  31.5 
 
 		 144 aa  46.6  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.1 
 
 		 298 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.168664  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5322  cytochrome c class I  29.47 
 
 		 346 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0021785  normal  0.0885214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0683  cytochrome c class I  29.81 
 
 		 381 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0573  cytochrome c, class I  31 
 
 		 196 aa  45.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0439994  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3043  cytochrome c class I  30.09 
 
 		 163 aa  44.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5013  cytochrome d1, heme region  19.5 
 
 		 413 aa  44.3  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0014  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.48 
 
 		 293 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2602  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.12 
 
 		 308 aa  43.5  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000191523  normal  0.411563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2794  cytochrome-c oxidase fixP chain  30 
 
 		 290 aa  43.5  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40028  normal  0.764362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>