66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1921 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1921  cytochrome d1, heme region  100 
 
 		 541 aa  1112    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0591  cytochrome d1, heme region  85.5 
 
 		 538 aa  939    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  25.05 
 
 		 519 aa  91.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  29.66 
 
 		 546 aa  91.3  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3323  cytochrome c, class I:cytochrome d1, heme region  25.2 
 
 		 576 aa  85.9  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000018049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3274  cytochrome d1, heme region  25 
 
 		 561 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4220  nitrite reductase  23.94 
 
 		 542 aa  82  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0434848  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0620  nitrite reductase precursor  24.74 
 
 		 568 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06750  nitrite reductase precursor  24.74 
 
 		 568 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  25.95 
 
 		 542 aa  78.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06650  putative c-type cytochrome  24.54 
 
 		 493 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3172  cytochrome d1, heme region  25 
 
 		 549 aa  74.7  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5010  hydroxylamine reductase  23.28 
 
 		 567 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824886  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0462  Hydroxylamine reductase  23.66 
 
 		 553 aa  73.9  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000301578  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  25.29 
 
 		 493 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1912  nitrite reductase (NO-forming)  23.66 
 
 		 574 aa  73.9  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1717  Hydroxylamine reductase  23.66 
 
 		 574 aa  73.9  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3029  cytochrome d1 heme subunit  23.35 
 
 		 527 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0652  Nitrite reductase (NO-forming)  23.9 
 
 		 565 aa  70.5  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0339  Hydroxylamine reductase  24.51 
 
 		 548 aa  69.7  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000373839  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  23.92 
 
 		 504 aa  69.7  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3430  hydroxylamine reductase  21.38 
 
 		 690 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133713  decreased coverage  0.000818462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3125  hydroxylamine reductase  24.74 
 
 		 574 aa  68.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.74527  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1442  hydroxylamine reductase  22.65 
 
 		 573 aa  66.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3180  nitrite reductase precursor  25.84 
 
 		 583 aa  65.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.795013  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0075  heme d1 biosynthesis protein NirF  23 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.61983 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0077  nitrite reductase (NO-forming)  23.16 
 
 		 575 aa  64.7  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.459085 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  23.99 
 
 		 503 aa  63.9  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0070  nitrite reductase (NO-forming)  27.61 
 
 		 517 aa  62.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.532245  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2618  Nitrite reductase (NO-forming)  22.18 
 
 		 560 aa  62.4  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0412143  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2487  hydroxylamine reductase  25.4 
 
 		 596 aa  61.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.756283 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  23.84 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  22.3 
 
 		 525 aa  59.7  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  22.38 
 
 		 542 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  37.68 
 
 		 528 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  22.13 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  22.96 
 
 		 517 aa  56.2  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.66 
 
 		 345 aa  55.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2608  cytochrome d1 heme region  23 
 
 		 547 aa  55.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213874  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1910  cytochrome d1, heme region  26.71 
 
 		 404 aa  53.9  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1715  cytochrome d1 heme region  26.71 
 
 		 404 aa  53.9  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.792941  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3123  cytochrome d1, heme region  29.36 
 
 		 400 aa  52.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475371  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0690  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.32 
 
 		 299 aa  50.8  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.408931 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3270  cytochrome d1, heme region  25 
 
 		 387 aa  50.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2490  cytochrome d1, heme region  28.18 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06720  heme d1 biosynthesis protein NirF  28.44 
 
 		 392 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.729227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1252  putative signal peptide protein  23.67 
 
 		 330 aa  48.5  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  0.989203 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2495  cytochrome d1, heme region  22.15 
 
 		 484 aa  48.5  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0617  heme d1 biosynthesis protein NirF  27.52 
 
 		 392 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3177  cytochrome cd1  30.07 
 
 		 388 aa  48.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.976412 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2064  putative signal peptide protein  25.3 
 
 		 339 aa  47.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  20.92 
 
 		 335 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.63 
 
 		 348 aa  47.4  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.15 
 
 		 324 aa  47  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2068  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.11 
 
 		 328 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5013  cytochrome d1, heme region  29.2 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.83 
 
 		 317 aa  45.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1172  cytochrome d1 heme region  23.72 
 
 		 331 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.912749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1976  hypothetical protein  32.19 
 
 		 640 aa  44.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1444  cytochrome d1 heme region  21.63 
 
 		 397 aa  45.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1080  cytochrome d1 heme region  24.15 
 
 		 331 aa  44.3  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.952849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2080  cytochrome d1, heme region  26.71 
 
 		 390 aa  44.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79845  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.14 
 
 		 328 aa  44.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.53 
 
 		 366 aa  44.3  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2613  cytochrome d1 heme region  24.24 
 
 		 402 aa  43.9  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683986  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4223  nirF protein  20.38 
 
 		 413 aa  43.5  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>