73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0591 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0591  cytochrome d1, heme region  100 
 
 		 538 aa  1105    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1921  cytochrome d1, heme region  86.25 
 
 		 541 aa  929    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3331  cytochrome d1, heme region  26.12 
 
 		 519 aa  98.2  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  31.43 
 
 		 546 aa  92  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3323  cytochrome c, class I:cytochrome d1, heme region  25.44 
 
 		 576 aa  87.8  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000018049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3274  cytochrome d1, heme region  26.01 
 
 		 561 aa  83.6  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3029  cytochrome d1 heme subunit  23.18 
 
 		 527 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06750  nitrite reductase precursor  26.05 
 
 		 568 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0620  nitrite reductase precursor  25.53 
 
 		 568 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4220  nitrite reductase  25.37 
 
 		 542 aa  80.5  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0434848  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  26.65 
 
 		 542 aa  79.7  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3172  cytochrome d1, heme region  25.9 
 
 		 549 aa  77.8  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0075  heme d1 biosynthesis protein NirF  23.97 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.61983 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5010  hydroxylamine reductase  25.37 
 
 		 567 aa  77  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824886  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1442  hydroxylamine reductase  23.26 
 
 		 573 aa  73.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1717  Hydroxylamine reductase  23.41 
 
 		 574 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1912  nitrite reductase (NO-forming)  23.41 
 
 		 574 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06650  putative c-type cytochrome  22.64 
 
 		 493 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0252622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  22.64 
 
 		 493 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3125  hydroxylamine reductase  24.42 
 
 		 574 aa  71.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.74527  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0339  Hydroxylamine reductase  24.19 
 
 		 548 aa  70.1  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000373839  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3180  nitrite reductase precursor  26.96 
 
 		 583 aa  68.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.795013  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3430  hydroxylamine reductase  22.83 
 
 		 690 aa  67.4  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133713  decreased coverage  0.000818462 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0077  nitrite reductase (NO-forming)  25.6 
 
 		 575 aa  67.4  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.459085 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  23.58 
 
 		 503 aa  67  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  24.27 
 
 		 525 aa  67  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0462  Hydroxylamine reductase  22.58 
 
 		 553 aa  66.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000301578  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  24.52 
 
 		 504 aa  66.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  22.31 
 
 		 566 aa  63.5  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2618  Nitrite reductase (NO-forming)  24.6 
 
 		 560 aa  63.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0412143  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  22.31 
 
 		 542 aa  63.5  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2487  hydroxylamine reductase  25 
 
 		 596 aa  62.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.756283 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0070  nitrite reductase (NO-forming)  25.06 
 
 		 517 aa  62.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.532245  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  23.61 
 
 		 528 aa  61.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  24.16 
 
 		 493 aa  61.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2608  cytochrome d1 heme region  22.19 
 
 		 547 aa  61.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213874  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0652  Nitrite reductase (NO-forming)  22.69 
 
 		 565 aa  60.5  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  23.56 
 
 		 517 aa  59.7  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3177  cytochrome cd1  23.61 
 
 		 388 aa  54.3  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.976412 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1910  cytochrome d1, heme region  26.71 
 
 		 404 aa  53.9  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1715  cytochrome d1 heme region  26.71 
 
 		 404 aa  53.9  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.792941  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2490  cytochrome d1, heme region  21.18 
 
 		 384 aa  53.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.55 
 
 		 329 aa  52.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.22 
 
 		 345 aa  52.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.12 
 
 		 317 aa  52.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2474  hypothetical protein  22.29 
 
 		 364 aa  52  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.686605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  20.7 
 
 		 324 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1252  putative signal peptide protein  23.77 
 
 		 330 aa  50.4  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  0.989203 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3123  cytochrome d1, heme region  26.61 
 
 		 400 aa  50.4  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475371  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  20.08 
 
 		 335 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3270  cytochrome d1, heme region  23.06 
 
 		 387 aa  50.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.45 
 
 		 327 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0690  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  21.26 
 
 		 299 aa  48.9  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.408931 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2495  cytochrome d1, heme region  22.87 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.74 
 
 		 366 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.21 
 
 		 325 aa  48.5  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.43 
 
 		 348 aa  47.8  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06720  heme d1 biosynthesis protein NirF  27.52 
 
 		 392 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.729227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4223  nirF protein  20.28 
 
 		 413 aa  47  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  21.15 
 
 		 362 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2068  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.32 
 
 		 328 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2613  cytochrome d1 heme region  20.53 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.683986  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0617  heme d1 biosynthesis protein NirF  26.61 
 
 		 392 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1172  cytochrome d1 heme region  24.22 
 
 		 331 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.912749  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1892  hypothetical protein  23.25 
 
 		 334 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1080  cytochrome d1 heme region  24.22 
 
 		 331 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.952849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.55 
 
 		 328 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1444  cytochrome d1 heme region  21.1 
 
 		 397 aa  45.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2080  cytochrome d1, heme region  22.64 
 
 		 390 aa  44.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79845  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  20.26 
 
 		 362 aa  44.3  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.19 
 
 		 311 aa  44.3  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5700  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.12 
 
 		 362 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.851059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1976  hypothetical protein  31.51 
 
 		 640 aa  43.9  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>