175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5945 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  100 
 
 		 642 aa  1281    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  80.31 
 
 		 640 aa  1025    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  54.72 
 
 		 643 aa  641    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  79.25 
 
 		 642 aa  1023    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  79.25 
 
 		 642 aa  1023    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  56.63 
 
 		 644 aa  676    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  80.47 
 
 		 640 aa  1030    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  53.88 
 
 		 649 aa  596  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  51.58 
 
 		 652 aa  580  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  50 
 
 		 653 aa  567  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  49.11 
 
 		 647 aa  559  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  48.26 
 
 		 664 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  38.94 
 
 		 645 aa  437  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  40.03 
 
 		 653 aa  423  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  43.14 
 
 		 657 aa  391  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  37.18 
 
 		 637 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  35.4 
 
 		 652 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  37.31 
 
 		 633 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  35.29 
 
 		 683 aa  355  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  36.79 
 
 		 636 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  36.92 
 
 		 647 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  36.96 
 
 		 647 aa  349  7e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  36.85 
 
 		 632 aa  343  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  37.05 
 
 		 652 aa  340  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  35.81 
 
 		 631 aa  334  4e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  35.48 
 
 		 632 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  36.07 
 
 		 629 aa  327  6e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  53.15 
 
 		 254 aa  236  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  35.1 
 
 		 639 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  35.1 
 
 		 639 aa  162  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  35.1 
 
 		 639 aa  163  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0450  FTR1 family iron permease  32.85 
 
 		 679 aa  159  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168197  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  35.05 
 
 		 634 aa  158  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2017  iron permease FTR1  32.49 
 
 		 413 aa  157  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00650927  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  34.44 
 
 		 572 aa  154  4e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  35.74 
 
 		 634 aa  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2809  Iron permease FTR1  29.81 
 
 		 660 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1022  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  29.38 
 
 		 556 aa  137  8e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  33.23 
 
 		 396 aa  134  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1170  iron permease, FTR1 family  30.29 
 
 		 691 aa  134  5e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.900718  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0524  FTR1 family iron permease  29.34 
 
 		 637 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.210875  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0763  superoxide dismutase  29.62 
 
 		 647 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.745778  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2443  iron permease FTR1  32.97 
 
 		 399 aa  131  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1649  FTR1 family iron permease  30.03 
 
 		 696 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  27.96 
 
 		 646 aa  131  5.0000000000000004e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1830  FTR1 family iron permease  29.75 
 
 		 696 aa  130  8.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2018  FTR1 family iron permease  29.15 
 
 		 696 aa  126  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1255  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  28.49 
 
 		 603 aa  122  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0393  hypothetical protein  27.91 
 
 		 570 aa  118  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0403  hypothetical protein  27.91 
 
 		 570 aa  118  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1510  hypothetical protein  30.43 
 
 		 422 aa  109  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000353289  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0468  iron permease FTR1  29.62 
 
 		 820 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402804  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2692  iron permease FTR1  33.46 
 
 		 273 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4468  iron permease FTR1  29.07 
 
 		 779 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390175  normal  0.0190609 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2435  iron permease FTR1  26.2 
 
 		 743 aa  95.5  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5728  iron permease FTR1  28 
 
 		 846 aa  92  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0820  iron permease FTR1  27.13 
 
 		 782 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.594209  hitchhiker  0.0000623566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1870  iron permease FTR1  27.31 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  32.88 
 
 		 315 aa  76.3  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  29.41 
 
 		 308 aa  75.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  33.11 
 
 		 254 aa  75.5  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3348  iron permease FTR1  31.88 
 
 		 677 aa  72.8  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  29.72 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4773  iron permease FTR1  31.94 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  33.8 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  29.72 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1914  iron permease FTR1  35.44 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  30.16 
 
 		 308 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2330  High-affinity Fe2+/Pb2+ permease-like protein  26.56 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00178906  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1660  iron permease FTR1  29.63 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  29.87 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1936  iron permease FTR1  31.67 
 
 		 279 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7009  iron permease FTR1  31.05 
 
 		 291 aa  63.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.35089 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1952  iron permease FTR1  31.19 
 
 		 304 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495146  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0120  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  35.64 
 
 		 339 aa  62  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1568  iron permease FTR1  30.9 
 
 		 304 aa  62  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  26.74 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  23.81 
 
 		 702 aa  59.3  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  23.81 
 
 		 702 aa  59.3  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0433  iron permease FTR1  30.04 
 
 		 278 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287745 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  29.02 
 
 		 579 aa  59.3  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3403  iron permease FTR1  31.75 
 
 		 702 aa  58.5  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4318  iron permease FTR1  35.33 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000385507  hitchhiker  0.00248903 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  27.56 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  26.7 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  38.3 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  27.23 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2579  FTR1 family protein  27.14 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4257  iron permease FTR1  35.33 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1258  iron permease FTR1 family protein  27.14 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.52486 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01026  hypothetical protein  27.14 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1132  iron permease FTR1 family protein  27.14 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0198612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1136  FTR1 family iron permease  27.14 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.161686  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01019  putative membrane protein  27.14 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.348057  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2106  iron permease FTR1 family protein  27.14 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.178558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0101  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  34.34 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000967148 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 388 aa  57  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  28.96 
 
 		 537 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  35.71 
 
 		 388 aa  57  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  25.56 
 
 		 284 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>