151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0824 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  100 
 
 		 296 aa  619  1e-176  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  40.51 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  34.6 
 
 		 314 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6394  hypothetical protein  33.62 
 
 		 687 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  28.92 
 
 		 683 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2859  hypothetical protein  31.13 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0235479 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2959  cytochrome c class I  36.08 
 
 		 571 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  31.61 
 
 		 644 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  36.79 
 
 		 649 aa  65.1  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  26.45 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0369  hypothetical protein  27.97 
 
 		 535 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0101  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  27.88 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000967148 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0377  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.4 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590381  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  25 
 
 		 683 aa  56.2  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2376  hypothetical protein  29.22 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256417  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  29.44 
 
 		 702 aa  55.8  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  29.44 
 
 		 702 aa  55.8  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  35.78 
 
 		 653 aa  55.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  33.94 
 
 		 647 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1021  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c subunit  26.24 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121328  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  30.56 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  34.95 
 
 		 647 aa  54.7  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4136  cytochrome c class I  25.99 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  30.97 
 
 		 388 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  34.26 
 
 		 652 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  33.03 
 
 		 636 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  26.74 
 
 		 513 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  33.03 
 
 		 647 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  31.48 
 
 		 389 aa  53.5  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  31.48 
 
 		 389 aa  53.1  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  33.96 
 
 		 643 aa  53.1  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  30.25 
 
 		 398 aa  52.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  33.64 
 
 		 640 aa  52.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  36.11 
 
 		 645 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  33.03 
 
 		 664 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  25.67 
 
 		 513 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  30.56 
 
 		 401 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0120  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  28.35 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  25.74 
 
 		 382 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  35.78 
 
 		 633 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0574  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  27.59 
 
 		 615 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  26.27 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  30.43 
 
 		 380 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  27.12 
 
 		 557 aa  50.4  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1598  cytochrome c, class I  33.63 
 
 		 128 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  33.02 
 
 		 642 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 388 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6691  hypothetical protein  33 
 
 		 171 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  31.93 
 
 		 151 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1798  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.21 
 
 		 292 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  29.63 
 
 		 642 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4116  cytochrome c class I  30.84 
 
 		 124 aa  50.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  29.58 
 
 		 392 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  36.7 
 
 		 652 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4137  cytochrome c class I  25.97 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  29.63 
 
 		 642 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  33.03 
 
 		 632 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  25.67 
 
 		 513 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  30.19 
 
 		 395 aa  49.7  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  26.37 
 
 		 629 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  34.86 
 
 		 631 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2277  cytochrome c, class I  31.86 
 
 		 128 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  28.7 
 
 		 151 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  32.69 
 
 		 637 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1674  cytochrome c class I  32.74 
 
 		 128 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  32.71 
 
 		 640 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  30.68 
 
 		 652 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  27.97 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3134  cytochrome c class I  25 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  32.11 
 
 		 632 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3238  cytochrome c family protein  27.21 
 
 		 174 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  32.43 
 
 		 653 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4164  hypothetical protein  32.43 
 
 		 147 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.277093  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  27.27 
 
 		 513 aa  47  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 		 400 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  25 
 
 		 190 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  31.19 
 
 		 190 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  31.19 
 
 		 190 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  31.19 
 
 		 190 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  24.71 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1103  putative cytochrome c class I protein  24.46 
 
 		 181 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  25.52 
 
 		 518 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0328  cytochrome c, class I  24.6 
 
 		 262 aa  45.8  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000605449  hitchhiker  0.0000000937241 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  28.45 
 
 		 138 aa  45.8  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  30.25 
 
 		 200 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0148  cytochrome c, class I  24.88 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1272  cytochrome c, class I  28.93 
 
 		 143 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.139813  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1391  cytochrome c, class I  29.73 
 
 		 151 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3248  cytochrome c, class I  28.93 
 
 		 143 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517083  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0070  putative cytochrome c class I protein  27.01 
 
 		 199 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.327353 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1450  cytochrome c  41.38 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.901546 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  32.99 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  29.52 
 
 		 657 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1415  cytochrome c class I  29.47 
 
 		 123 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0573  cytochrome c, class I  27.88 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0439994  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  24.86 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2676  hypothetical protein  23.86 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.543217 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  28.72 
 
 		 380 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  26.32 
 
 		 394 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0461  cytochrome d1 heme region  28.12 
 
 		 556 aa  44.3  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00181768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>