54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0288 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0288  cytochrome c class I  100 
 
 		 416 aa  865    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  38.86 
 
 		 427 aa  288  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  39.01 
 
 		 435 aa  281  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  37.44 
 
 		 444 aa  280  4e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  37.01 
 
 		 400 aa  276  7e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5664  cytochrome c class I  35.76 
 
 		 443 aa  242  9e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  50 
 
 		 425 aa  209  9e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1426  membrane protein containing cytochrome c domain protein  45.96 
 
 		 233 aa  206  5e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  30.9 
 
 		 215 aa  132  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3982  cytochrome c family protein  33.75 
 
 		 253 aa  132  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1237  chaperone protein HtpG  31.25 
 
 		 214 aa  125  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250059  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0795  hypothetical protein  35.18 
 
 		 216 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3935  cytochrome c family protein  32.82 
 
 		 217 aa  119  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0847  hypothetical protein  34.67 
 
 		 216 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554273  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0843  hypothetical protein  34.67 
 
 		 216 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0840  hypothetical protein  33.67 
 
 		 216 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  32.07 
 
 		 219 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2550  cytochrome c family protein  32 
 
 		 181 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1596  chaperone protein HtpG  29.31 
 
 		 216 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4188  chaperone protein HtpG  32.51 
 
 		 218 aa  113  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4427  chaperone protein HtpG  32.99 
 
 		 216 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0159  chaperone protein HtpG  38.31 
 
 		 219 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  hitchhiker  0.00859507 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6222  chaperone protein HtpG  30.2 
 
 		 219 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385965  decreased coverage  0.00955528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0215  chaperone protein HtpG  33.81 
 
 		 219 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1809  hypothetical protein  38.89 
 
 		 171 aa  110  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0786634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0017  chaperone protein HtpG  37.66 
 
 		 219 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.247503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1525  hypothetical protein  32.98 
 
 		 220 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.415046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2714  hypothetical protein  34.76 
 
 		 214 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.272646  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6894  chaperone protein HtpG  28.23 
 
 		 229 aa  106  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5825  chaperone protein HtpG  28.12 
 
 		 218 aa  106  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024458  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5956  chaperone protein HtpG  29.51 
 
 		 220 aa  103  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0221  cytochrome c family protein  31.43 
 
 		 211 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1044  chaperone protein HtpG  29.68 
 
 		 219 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3004  chaperone protein HtpG  31.03 
 
 		 238 aa  99.8  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955215 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1215  putative cytochrome c  35.44 
 
 		 234 aa  99  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.422839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2778  hypothetical protein  35.4 
 
 		 171 aa  97.1  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1462  hypothetical protein  27.75 
 
 		 226 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0873129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0836  putative chaperone protein HtpG  27.54 
 
 		 217 aa  95.1  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.199398  normal  0.167985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4139  hypothetical protein  30.5 
 
 		 220 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0122  hypothetical protein  32.7 
 
 		 183 aa  94.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0103  hypothetical protein  32.7 
 
 		 183 aa  93.6  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108183 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0408  hypothetical protein  37.35 
 
 		 149 aa  68.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0357243  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  32.35 
 
 		 561 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2268  hypothetical protein  27.23 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3390  hypothetical protein  27.1 
 
 		 179 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2690  hypothetical protein  25.74 
 
 		 211 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0297464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2546  hypothetical protein  27.63 
 
 		 220 aa  53.5  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000133101  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2932  hypothetical protein  26.96 
 
 		 209 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2297  hypothetical protein  30.48 
 
 		 302 aa  51.2  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2573  hypothetical protein  32.35 
 
 		 593 aa  51.2  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0611  hypothetical protein  28.12 
 
 		 184 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0270  hypothetical protein  27.27 
 
 		 178 aa  47.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0340  cytochrome d1 heme region  32.95 
 
 		 557 aa  46.2  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000596399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2124  hypothetical protein  26.74 
 
 		 247 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>