47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2932 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2932  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  440  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2268  hypothetical protein  70 
 
 		 210 aa  315  5e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2690  hypothetical protein  70.62 
 
 		 211 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0297464 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0270  hypothetical protein  59.38 
 
 		 178 aa  238  2.9999999999999997e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3390  hypothetical protein  55.61 
 
 		 179 aa  230  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2546  hypothetical protein  42.65 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000133101  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0611  hypothetical protein  44.2 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  31.97 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5825  chaperone protein HtpG  30.68 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024458  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6222  chaperone protein HtpG  32.88 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385965  decreased coverage  0.00955528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6894  chaperone protein HtpG  29.57 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1596  chaperone protein HtpG  29.26 
 
 		 216 aa  72  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0836  putative chaperone protein HtpG  28.9 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.199398  normal  0.167985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3004  chaperone protein HtpG  31.97 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2778  hypothetical protein  27.81 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1809  hypothetical protein  28.57 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0786634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4188  chaperone protein HtpG  28.57 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0221  cytochrome c family protein  26.14 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1525  hypothetical protein  33.1 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.415046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1237  chaperone protein HtpG  29.94 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250059  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0159  chaperone protein HtpG  32.41 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  hitchhiker  0.00859507 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1215  putative cytochrome c  30.83 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.422839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0017  chaperone protein HtpG  31.72 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.247503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0215  chaperone protein HtpG  32.41 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0103  hypothetical protein  26.23 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2550  cytochrome c family protein  26.34 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3935  cytochrome c family protein  29.86 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0122  hypothetical protein  24.32 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4427  chaperone protein HtpG  25 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4139  hypothetical protein  26.67 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5956  chaperone protein HtpG  36.08 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  29.53 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3982  cytochrome c family protein  31.03 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0840  hypothetical protein  33.66 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0843  hypothetical protein  30.83 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0795  hypothetical protein  30.83 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0847  hypothetical protein  30.83 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554273  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1462  hypothetical protein  24.88 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0873129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  25.45 
 
 		 400 aa  58.9  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  23.45 
 
 		 435 aa  58.5  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1044  chaperone protein HtpG  25.85 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2714  hypothetical protein  31.96 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.272646  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5664  cytochrome c class I  26.53 
 
 		 443 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  25.44 
 
 		 425 aa  52.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0288  cytochrome c class I  26.96 
 
 		 416 aa  52.4  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1426  membrane protein containing cytochrome c domain protein  23.56 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  23.39 
 
 		 444 aa  45.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>