11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2124 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2124  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1356  hypothetical protein  32.09 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128227 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0408  hypothetical protein  28.57 
 
 		 149 aa  49.3  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0357243  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  30.49 
 
 		 435 aa  48.5  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2297  hypothetical protein  28.92 
 
 		 302 aa  47  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  29.03 
 
 		 561 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  32.32 
 
 		 400 aa  45.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  30.77 
 
 		 427 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0288  cytochrome c class I  26.44 
 
 		 416 aa  43.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  36.59 
 
 		 644 aa  42.7  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  30.51 
 
 		 444 aa  42  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>