48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0611 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0611  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  385  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295939  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3390  hypothetical protein  52.35 
 
 
179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2268  hypothetical protein  46.32 
 
 
210 aa  176  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2690  hypothetical protein  44.62 
 
 
211 aa  175  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0297464 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0270  hypothetical protein  45.25 
 
 
178 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149554  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2546  hypothetical protein  40.98 
 
 
220 aa  170  7.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000133101  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2932  hypothetical protein  44.62 
 
 
209 aa  150  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2778  hypothetical protein  27.68 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1809  hypothetical protein  27.27 
 
 
171 aa  79  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0786634  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1525  hypothetical protein  29.73 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.415046  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4188  chaperone protein HtpG  27.56 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1596  chaperone protein HtpG  27.88 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1237  chaperone protein HtpG  30.3 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250059  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3004  chaperone protein HtpG  27.01 
 
 
238 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955215 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  28.99 
 
 
435 aa  64.7  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4427  chaperone protein HtpG  29.2 
 
 
216 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  29.67 
 
 
444 aa  63.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0103  hypothetical protein  28.57 
 
 
183 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0122  hypothetical protein  28.41 
 
 
183 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0836  putative chaperone protein HtpG  28.3 
 
 
217 aa  62.8  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.199398  normal  0.167985 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6222  chaperone protein HtpG  33.33 
 
 
219 aa  62  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385965  decreased coverage  0.00955528 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3982  cytochrome c family protein  29.21 
 
 
253 aa  61.6  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2550  cytochrome c family protein  25.43 
 
 
181 aa  61.6  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  27.69 
 
 
427 aa  60.5  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5956  chaperone protein HtpG  28.57 
 
 
220 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.387294  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0159  chaperone protein HtpG  30 
 
 
219 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  hitchhiker  0.00859507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0215  chaperone protein HtpG  31.58 
 
 
219 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0840  hypothetical protein  33.6 
 
 
216 aa  57.8  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373903  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5825  chaperone protein HtpG  32.04 
 
 
218 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024458  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4139  hypothetical protein  22.73 
 
 
220 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0221  cytochrome c family protein  26.35 
 
 
211 aa  56.6  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3935  cytochrome c family protein  29.01 
 
 
217 aa  55.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442182  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1044  chaperone protein HtpG  26.99 
 
 
219 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0017  chaperone protein HtpG  31.48 
 
 
219 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.247503  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  26.22 
 
 
215 aa  55.1  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6894  chaperone protein HtpG  29.63 
 
 
229 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  24.57 
 
 
219 aa  54.7  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1462  hypothetical protein  24.71 
 
 
226 aa  54.3  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0873129  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5664  cytochrome c class I  28.79 
 
 
443 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239336  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0795  hypothetical protein  30.28 
 
 
216 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0843  hypothetical protein  30.28 
 
 
216 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  28.17 
 
 
425 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0847  hypothetical protein  30.28 
 
 
216 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554273  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2714  hypothetical protein  26.75 
 
 
214 aa  51.2  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.272646  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0288  cytochrome c class I  28.14 
 
 
416 aa  51.2  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1426  membrane protein containing cytochrome c domain protein  26.42 
 
 
233 aa  50.1  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1215  putative cytochrome c  26.67 
 
 
234 aa  43.9  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.422839  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  24.36 
 
 
400 aa  41.2  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>