81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3477 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  100 
 
 		 425 aa  874    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5664  cytochrome c class I  62.33 
 
 		 443 aa  492  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  46.3 
 
 		 435 aa  350  3e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  43.63 
 
 		 444 aa  319  6e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  37.59 
 
 		 427 aa  289  5.0000000000000004e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  38.59 
 
 		 400 aa  285  8e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0288  cytochrome c class I  39.33 
 
 		 416 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1426  membrane protein containing cytochrome c domain protein  45.85 
 
 		 233 aa  201  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3935  cytochrome c family protein  45.26 
 
 		 217 aa  156  8e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  41.76 
 
 		 219 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3982  cytochrome c family protein  38.89 
 
 		 253 aa  147  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0843  hypothetical protein  44.79 
 
 		 216 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0847  hypothetical protein  44.79 
 
 		 216 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554273  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0795  hypothetical protein  44.17 
 
 		 216 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0840  hypothetical protein  49.62 
 
 		 216 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  39.23 
 
 		 215 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6222  chaperone protein HtpG  38.55 
 
 		 219 aa  143  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385965  decreased coverage  0.00955528 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0221  cytochrome c family protein  38.51 
 
 		 211 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1596  chaperone protein HtpG  42.48 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0159  chaperone protein HtpG  42.75 
 
 		 219 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  hitchhiker  0.00859507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0215  chaperone protein HtpG  42.75 
 
 		 219 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4188  chaperone protein HtpG  36.93 
 
 		 218 aa  137  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4427  chaperone protein HtpG  43.09 
 
 		 216 aa  137  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0017  chaperone protein HtpG  42.86 
 
 		 219 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.247503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6894  chaperone protein HtpG  40.69 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5956  chaperone protein HtpG  37.08 
 
 		 220 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1809  hypothetical protein  46.51 
 
 		 171 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0786634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5825  chaperone protein HtpG  37.21 
 
 		 218 aa  133  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024458  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1525  hypothetical protein  41.54 
 
 		 220 aa  133  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.415046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1237  chaperone protein HtpG  36.42 
 
 		 214 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250059  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2550  cytochrome c family protein  39.61 
 
 		 181 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0836  putative chaperone protein HtpG  37.36 
 
 		 217 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.199398  normal  0.167985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1044  chaperone protein HtpG  42.03 
 
 		 219 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2714  hypothetical protein  34.39 
 
 		 214 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.272646  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3004  chaperone protein HtpG  36.63 
 
 		 238 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2778  hypothetical protein  42.31 
 
 		 171 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0122  hypothetical protein  40.58 
 
 		 183 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0103  hypothetical protein  39.86 
 
 		 183 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1462  hypothetical protein  37.11 
 
 		 226 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0873129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4139  hypothetical protein  41.32 
 
 		 220 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1215  putative cytochrome c  41.67 
 
 		 234 aa  115  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.422839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2297  hypothetical protein  30 
 
 		 302 aa  87.8  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0408  hypothetical protein  37.78 
 
 		 149 aa  84.3  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0357243  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  37.72 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2573  hypothetical protein  32.91 
 
 		 593 aa  76.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2546  hypothetical protein  33.63 
 
 		 220 aa  75.5  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000133101  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1019  hypothetical protein  32.35 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  30.21 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  33.64 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  32.29 
 
 		 327 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3390  hypothetical protein  26.67 
 
 		 179 aa  66.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0692  cytochrome c class I  37.78 
 
 		 153 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.189823  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  29.81 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2268  hypothetical protein  26.06 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2690  hypothetical protein  25.45 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0297464 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0446  cytochrome c class I  38.64 
 
 		 169 aa  58.9  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000163065  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3450  cytochrome c, class I  32.56 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0773  cytochrome c, class I  29.89 
 
 		 326 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0202  cytochrome c class I  28.03 
 
 		 264 aa  53.9  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0611  hypothetical protein  28.03 
 
 		 184 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.38 
 
 		 487 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0270  hypothetical protein  26.52 
 
 		 178 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  32.38 
 
 		 535 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.38 
 
 		 535 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.38 
 
 		 487 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.38 
 
 		 535 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  32.38 
 
 		 535 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  31.43 
 
 		 535 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1274  cytochrome c class I  28.74 
 
 		 166 aa  49.7  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2011  hypothetical protein  28.89 
 
 		 152 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  30.65 
 
 		 278 aa  48.9  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  26.71 
 
 		 340 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0848  cytochrome c class I  42.03 
 
 		 121 aa  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2932  hypothetical protein  26.24 
 
 		 209 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.73 
 
 		 487 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  32.77 
 
 		 367 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1478  cytochrome CytM  43.48 
 
 		 145 aa  44.3  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.611234 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2424  cytochrome c class I  35.04 
 
 		 132 aa  43.9  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4020  cytochrome c, class I  36.99 
 
 		 124 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442148  normal  0.970341 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  33.68 
 
 		 200 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>