53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4188 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4188  chaperone protein HtpG  100 
 
 		 218 aa  455  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6894  chaperone protein HtpG  69.86 
 
 		 229 aa  330  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5825  chaperone protein HtpG  69.59 
 
 		 218 aa  324  5e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024458  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0159  chaperone protein HtpG  68.95 
 
 		 219 aa  324  6e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  hitchhiker  0.00859507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0215  chaperone protein HtpG  68.49 
 
 		 219 aa  322  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0017  chaperone protein HtpG  68.04 
 
 		 219 aa  321  6e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.247503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6222  chaperone protein HtpG  63.01 
 
 		 219 aa  305  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385965  decreased coverage  0.00955528 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1596  chaperone protein HtpG  57.34 
 
 		 216 aa  274  9e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3004  chaperone protein HtpG  53.11 
 
 		 238 aa  255  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1237  chaperone protein HtpG  54.59 
 
 		 214 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250059  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  51.14 
 
 		 219 aa  238  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1044  chaperone protein HtpG  49.78 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0836  putative chaperone protein HtpG  52.29 
 
 		 217 aa  231  7.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.199398  normal  0.167985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1525  hypothetical protein  50.67 
 
 		 220 aa  231  8.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.415046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5956  chaperone protein HtpG  51.56 
 
 		 220 aa  224  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4139  hypothetical protein  48.42 
 
 		 220 aa  222  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1462  hypothetical protein  49.32 
 
 		 226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0873129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0840  hypothetical protein  49.77 
 
 		 216 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4427  chaperone protein HtpG  49.32 
 
 		 216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0847  hypothetical protein  48.18 
 
 		 216 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554273  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0843  hypothetical protein  48.18 
 
 		 216 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0795  hypothetical protein  47.73 
 
 		 216 aa  207  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3982  cytochrome c family protein  42.2 
 
 		 253 aa  181  6e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  52.05 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0221  cytochrome c family protein  41.01 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2714  hypothetical protein  42.2 
 
 		 214 aa  167  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.272646  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3935  cytochrome c family protein  38.91 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  36.93 
 
 		 425 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5664  cytochrome c class I  35.8 
 
 		 443 aa  135  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  32.72 
 
 		 435 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0103  hypothetical protein  44.72 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0122  hypothetical protein  43.9 
 
 		 183 aa  124  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  31.84 
 
 		 444 aa  120  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1426  membrane protein containing cytochrome c domain protein  32.99 
 
 		 233 aa  119  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1215  putative cytochrome c  32.64 
 
 		 234 aa  118  6e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.422839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2550  cytochrome c family protein  37.11 
 
 		 181 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  31.19 
 
 		 427 aa  116  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  31.63 
 
 		 400 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0288  cytochrome c class I  32.51 
 
 		 416 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1809  hypothetical protein  33.13 
 
 		 171 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0786634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2778  hypothetical protein  35.15 
 
 		 171 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2546  hypothetical protein  32.89 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000133101  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2268  hypothetical protein  35.58 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2690  hypothetical protein  35.35 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0297464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2932  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0270  hypothetical protein  30.71 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0611  hypothetical protein  31.48 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3390  hypothetical protein  31.43 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  31.4 
 
 		 116 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  24.24 
 
 		 340 aa  42.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  26.35 
 
 		 711 aa  42.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  29.9 
 
 		 118 aa  42  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  27.4 
 
 		 347 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>