52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0103 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0103  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0122  hypothetical protein  94.54 
 
 
183 aa  348  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1044  chaperone protein HtpG  43.05 
 
 
219 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1809  hypothetical protein  42.38 
 
 
171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0786634  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1525  hypothetical protein  40.65 
 
 
220 aa  135  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.415046  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5956  chaperone protein HtpG  42 
 
 
220 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.387294  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1596  chaperone protein HtpG  39.88 
 
 
216 aa  132  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2778  hypothetical protein  43.33 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0836  putative chaperone protein HtpG  39.47 
 
 
217 aa  129  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.199398  normal  0.167985 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4188  chaperone protein HtpG  39.22 
 
 
218 aa  128  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0159  chaperone protein HtpG  39.47 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  hitchhiker  0.00859507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0215  chaperone protein HtpG  39.47 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1237  chaperone protein HtpG  40.13 
 
 
214 aa  125  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250059  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  37.18 
 
 
425 aa  125  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3004  chaperone protein HtpG  38.31 
 
 
238 aa  125  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955215 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0017  chaperone protein HtpG  38.82 
 
 
219 aa  125  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.247503  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  38.65 
 
 
219 aa  122  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3935  cytochrome c family protein  39.39 
 
 
217 aa  122  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442182  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1215  putative cytochrome c  47.41 
 
 
234 aa  122  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.422839  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5664  cytochrome c class I  36.67 
 
 
443 aa  122  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239336  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4427  chaperone protein HtpG  38.96 
 
 
216 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0843  hypothetical protein  38.82 
 
 
216 aa  120  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0847  hypothetical protein  38.82 
 
 
216 aa  120  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554273  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0795  hypothetical protein  38.82 
 
 
216 aa  120  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2550  cytochrome c family protein  42.03 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6894  chaperone protein HtpG  43.44 
 
 
229 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5825  chaperone protein HtpG  39.74 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024458  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6222  chaperone protein HtpG  40.98 
 
 
219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385965  decreased coverage  0.00955528 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2714  hypothetical protein  39.01 
 
 
214 aa  118  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.272646  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0840  hypothetical protein  37.5 
 
 
216 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373903  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  40.16 
 
 
215 aa  117  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0221  cytochrome c family protein  35.42 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  36.41 
 
 
444 aa  115  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  39.86 
 
 
435 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  34.67 
 
 
427 aa  112  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3982  cytochrome c family protein  30.69 
 
 
253 aa  112  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  34.07 
 
 
400 aa  108  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1426  membrane protein containing cytochrome c domain protein  36.84 
 
 
233 aa  106  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4139  hypothetical protein  33.97 
 
 
220 aa  102  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1462  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0873129  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0288  cytochrome c class I  32.7 
 
 
416 aa  95.1  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3390  hypothetical protein  30 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2268  hypothetical protein  27.46 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0270  hypothetical protein  28.34 
 
 
178 aa  70.9  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149554  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2932  hypothetical protein  25.65 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2690  hypothetical protein  24.19 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0297464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0611  hypothetical protein  28.76 
 
 
184 aa  61.6  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295939  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2546  hypothetical protein  24.3 
 
 
220 aa  60.8  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000133101  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  30.25 
 
 
458 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6280  hypothetical protein  30.61 
 
 
368 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0956  multihaem cytochrome  27.66 
 
 
446 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0959  multiheme cytochrome  26.95 
 
 
447 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>