49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3004 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3004  chaperone protein HtpG  100 
 
 
238 aa  503  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955215 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1596  chaperone protein HtpG  54.2 
 
 
216 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4188  chaperone protein HtpG  53.11 
 
 
218 aa  255  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0017  chaperone protein HtpG  51.04 
 
 
219 aa  251  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.247503  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0159  chaperone protein HtpG  50.21 
 
 
219 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  hitchhiker  0.00859507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0215  chaperone protein HtpG  50.21 
 
 
219 aa  250  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5825  chaperone protein HtpG  50.83 
 
 
218 aa  246  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024458  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6894  chaperone protein HtpG  50.41 
 
 
229 aa  245  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1044  chaperone protein HtpG  45.8 
 
 
219 aa  239  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6222  chaperone protein HtpG  48.55 
 
 
219 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385965  decreased coverage  0.00955528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  48.95 
 
 
219 aa  234  7e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1237  chaperone protein HtpG  48.75 
 
 
214 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250059  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1525  hypothetical protein  45.99 
 
 
220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.415046  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0836  putative chaperone protein HtpG  46.22 
 
 
217 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.199398  normal  0.167985 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5956  chaperone protein HtpG  47.5 
 
 
220 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.387294  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1462  hypothetical protein  45.83 
 
 
226 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0873129  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4139  hypothetical protein  44.17 
 
 
220 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4427  chaperone protein HtpG  43.27 
 
 
216 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0840  hypothetical protein  43.7 
 
 
216 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373903  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  45.5 
 
 
215 aa  193  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0847  hypothetical protein  41.6 
 
 
216 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554273  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0843  hypothetical protein  41.6 
 
 
216 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0795  hypothetical protein  41.6 
 
 
216 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0221  cytochrome c family protein  45.77 
 
 
211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3982  cytochrome c family protein  37.92 
 
 
253 aa  174  9e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3935  cytochrome c family protein  36.13 
 
 
217 aa  172  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442182  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2714  hypothetical protein  43.07 
 
 
214 aa  159  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.272646  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1215  putative cytochrome c  36.46 
 
 
234 aa  138  7e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.422839  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  36.63 
 
 
425 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5664  cytochrome c class I  37.86 
 
 
443 aa  125  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239336  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0122  hypothetical protein  42.52 
 
 
183 aa  122  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0103  hypothetical protein  42.06 
 
 
183 aa  122  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2550  cytochrome c family protein  37.18 
 
 
181 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  35.1 
 
 
444 aa  109  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  34.93 
 
 
435 aa  108  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2778  hypothetical protein  34.64 
 
 
171 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  31.11 
 
 
427 aa  104  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1809  hypothetical protein  38.02 
 
 
171 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0786634  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1426  membrane protein containing cytochrome c domain protein  36.18 
 
 
233 aa  101  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0288  cytochrome c class I  31.03 
 
 
416 aa  99.8  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  29.33 
 
 
400 aa  96.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2268  hypothetical protein  33.11 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2690  hypothetical protein  37.11 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0297464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2546  hypothetical protein  38.38 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000133101  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2932  hypothetical protein  31.29 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3390  hypothetical protein  27.65 
 
 
179 aa  63.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0611  hypothetical protein  30.28 
 
 
184 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295939  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0270  hypothetical protein  30.53 
 
 
178 aa  57.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149554  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  23.38 
 
 
340 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>