81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01315 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  100 
 
 
427 aa  895    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  67.42 
 
 
444 aa  576  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  42.86 
 
 
400 aa  332  9e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  41.97 
 
 
435 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1426  membrane protein containing cytochrome c domain protein  60.91 
 
 
233 aa  294  2e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0288  cytochrome c class I  37.59 
 
 
416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5664  cytochrome c class I  36.23 
 
 
443 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239336  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  45.66 
 
 
425 aa  206  6e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0795  hypothetical protein  32.2 
 
 
216 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0847  hypothetical protein  31.54 
 
 
216 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554273  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0843  hypothetical protein  31.54 
 
 
216 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3982  cytochrome c family protein  35.94 
 
 
253 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0840  hypothetical protein  32.1 
 
 
216 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373903  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1596  chaperone protein HtpG  30.17 
 
 
216 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0221  cytochrome c family protein  29.66 
 
 
211 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  29.82 
 
 
215 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1237  chaperone protein HtpG  33.17 
 
 
214 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250059  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1525  hypothetical protein  33.86 
 
 
220 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.415046  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3935  cytochrome c family protein  32.83 
 
 
217 aa  120  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442182  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  33.8 
 
 
219 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4427  chaperone protein HtpG  32.31 
 
 
216 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5956  chaperone protein HtpG  30 
 
 
220 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.387294  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6894  chaperone protein HtpG  30.46 
 
 
229 aa  117  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1809  hypothetical protein  34.39 
 
 
171 aa  116  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0786634  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4188  chaperone protein HtpG  31.19 
 
 
218 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0159  chaperone protein HtpG  38 
 
 
219 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  hitchhiker  0.00859507 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0017  chaperone protein HtpG  38 
 
 
219 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.247503  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0215  chaperone protein HtpG  38 
 
 
219 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2714  hypothetical protein  36.69 
 
 
214 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.272646  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6222  chaperone protein HtpG  33.14 
 
 
219 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385965  decreased coverage  0.00955528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5825  chaperone protein HtpG  33.33 
 
 
218 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024458  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2778  hypothetical protein  33.51 
 
 
171 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2550  cytochrome c family protein  29.61 
 
 
181 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0122  hypothetical protein  34 
 
 
183 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0836  putative chaperone protein HtpG  31.12 
 
 
217 aa  106  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.199398  normal  0.167985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1044  chaperone protein HtpG  29.22 
 
 
219 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1215  putative cytochrome c  35.58 
 
 
234 aa  104  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.422839  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3004  chaperone protein HtpG  31.11 
 
 
238 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955215 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0103  hypothetical protein  37.42 
 
 
183 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1462  hypothetical protein  30.56 
 
 
226 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0873129  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4139  hypothetical protein  29.44 
 
 
220 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0408  hypothetical protein  36.78 
 
 
149 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0357243  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2297  hypothetical protein  35.29 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2546  hypothetical protein  29.46 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000133101  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1019  hypothetical protein  33.04 
 
 
296 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0611  hypothetical protein  28.42 
 
 
184 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295939  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1274  cytochrome c class I  31.43 
 
 
166 aa  57.4  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  28.57 
 
 
561 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  27.55 
 
 
327 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  27.88 
 
 
327 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2690  hypothetical protein  31.16 
 
 
211 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0297464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  26.53 
 
 
327 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 
351 aa  53.9  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  29.29 
 
 
340 aa  53.5  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2268  hypothetical protein  30.65 
 
 
210 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0773  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
326 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3450  cytochrome c, class I  36.05 
 
 
326 aa  51.6  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  28.72 
 
 
356 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  30.86 
 
 
363 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3509  cytochrome c, class I  34 
 
 
278 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  34 
 
 
278 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3390  hypothetical protein  23.76 
 
 
179 aa  47.4  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0270  hypothetical protein  22.34 
 
 
178 aa  46.6  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149554  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2070  cytochrome c2  38.33 
 
 
122 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170009  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  31.31 
 
 
280 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  33 
 
 
278 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1287  cytochrome c class I  30.48 
 
 
122 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208797  normal  0.579933 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2124  hypothetical protein  30.77 
 
 
247 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  33 
 
 
278 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  33 
 
 
278 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  31.31 
 
 
277 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0446  cytochrome c class I  31.4 
 
 
169 aa  44.3  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000163065  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  34.74 
 
 
350 aa  43.9  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  34.12 
 
 
487 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1172  cytochrome c class I  39.44 
 
 
121 aa  43.9  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109894  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0525  cytochrome c, class I  40.54 
 
 
175 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0840816  normal  0.414033 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  34.12 
 
 
487 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  34.12 
 
 
535 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  34.12 
 
 
535 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1880  cytochrome c, class I  38.98 
 
 
122 aa  43.1  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  34.12 
 
 
535 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>