38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0408 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0408  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  307  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0357243  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  51.49 
 
 		 435 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  44.58 
 
 		 444 aa  88.2  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  44.71 
 
 		 400 aa  87.8  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5664  cytochrome c class I  44.94 
 
 		 443 aa  85.5  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2573  hypothetical protein  41.96 
 
 		 593 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  38.37 
 
 		 425 aa  81.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  35.11 
 
 		 427 aa  80.1  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2297  hypothetical protein  35.85 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0288  cytochrome c class I  37.35 
 
 		 416 aa  68.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  30.22 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0773  cytochrome c, class I  32.18 
 
 		 326 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  26.92 
 
 		 327 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 		 327 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  25 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3450  cytochrome c, class I  32.56 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1019  hypothetical protein  26.26 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  27.17 
 
 		 561 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  24.76 
 
 		 356 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  24.49 
 
 		 363 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2124  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2011  hypothetical protein  27.91 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0692  cytochrome c class I  27.85 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.189823  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 535 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 535 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 487 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 487 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 535 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  37.14 
 
 		 518 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2103  cytochrome c class I  27.48 
 
 		 124 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2147  cytochrome c class I  27.48 
 
 		 124 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.620434 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1274  cytochrome c class I  29.03 
 
 		 166 aa  42  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0446  cytochrome c class I  36.07 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000163065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0328  cytochrome c, class I  36.59 
 
 		 262 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000605449  hitchhiker  0.0000000937241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4020  cytochrome c, class I  28.46 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442148  normal  0.970341 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2412  cytochrome c class I  34.33 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000673714  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 		 535 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 		 535 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>