39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2297 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2297  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  628  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0408  hypothetical protein  39.53 
 
 		 149 aa  79  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0357243  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  35.29 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  35.29 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  37.65 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  31.78 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5664  cytochrome c class I  39.33 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  34.94 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  31.78 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2573  hypothetical protein  34.62 
 
 		 593 aa  63.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  30.85 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1019  hypothetical protein  34.12 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0446  cytochrome c class I  32.97 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000163065  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  37.93 
 
 		 518 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  31.15 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  27.2 
 
 		 340 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0773  cytochrome c, class I  34.48 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  29.17 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1274  cytochrome c class I  27.47 
 
 		 166 aa  53.1  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0288  cytochrome c class I  30.48 
 
 		 416 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  29.07 
 
 		 561 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3450  cytochrome c, class I  31.4 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  24 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2124  hypothetical protein  28.92 
 
 		 247 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  22.8 
 
 		 278 aa  45.8  0.0009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.76 
 
 		 487 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2011  hypothetical protein  29.03 
 
 		 152 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.76 
 
 		 535 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.76 
 
 		 535 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.76 
 
 		 487 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0692  cytochrome c class I  30.43 
 
 		 153 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.189823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  29.76 
 
 		 535 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  29.76 
 
 		 535 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1729  methyl-accepting chemotaxis protein  29.07 
 
 		 862 aa  42.7  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.371209  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  30.95 
 
 		 535 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3572  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  20.26 
 
 		 313 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0440  nitrous-oxide reductase  29.07 
 
 		 864 aa  42.4  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.136119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0328  cytochrome c, class I  43.48 
 
 		 262 aa  42.4  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000605449  hitchhiker  0.0000000937241 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>