40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0328 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0328  cytochrome c, class I  100 
 
 		 262 aa  534  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000605449  hitchhiker  0.0000000937241 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0202  cytochrome c class I  52.83 
 
 		 264 aa  258  6e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1019  hypothetical protein  38.89 
 
 		 296 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3450  cytochrome c, class I  36.82 
 
 		 326 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0773  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 326 aa  122  8e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0251  cytochrome c class I  31.46 
 
 		 274 aa  92.4  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2651  cytochrome c, class I  35.54 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.583086  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.98 
 
 		 487 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  35.37 
 
 		 535 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  33.73 
 
 		 535 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  36.08 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0692  cytochrome c class I  31.03 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.189823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  35.05 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  34.02 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  38.46 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.53 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3594  hypothetical protein  27.42 
 
 		 172 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516633 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.93 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  32.93 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.53 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2011  hypothetical protein  28.41 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.93 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  34.07 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1274  cytochrome c class I  30.12 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2169  hypothetical protein  36.08 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1709  hypothetical protein  38.71 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0053762  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1780  hypothetical protein  37.63 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.882538  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0446  cytochrome c class I  30.95 
 
 		 169 aa  52.8  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000163065  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1298  nitrous-oxide reductase  31.82 
 
 		 865 aa  49.7  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000502464  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1770  nitrous-oxide reductase NosZ  32.67 
 
 		 864 aa  48.5  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  27.45 
 
 		 444 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  24.06 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0010  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.77 
 
 		 863 aa  46.2  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0271061  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1729  methyl-accepting chemotaxis protein  33.77 
 
 		 862 aa  44.3  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.371209  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  24.6 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  39.39 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3033  cytochrome c class I  29 
 
 		 238 aa  42.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2297  hypothetical protein  43.48 
 
 		 302 aa  42.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  46.34 
 
 		 435 aa  42.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>