50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1450 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1450  cytochrome c  100 
 
 		 266 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.901546 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1419  cytochrome c  83.81 
 
 		 266 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1841  cytochrome c family protein  81.78 
 
 		 266 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.858581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3869  hypothetical protein  81.38 
 
 		 266 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.064259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1738  cytochrome c, class I  68.48 
 
 		 275 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2593  hypothetical protein  68.34 
 
 		 269 aa  360  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.572119  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2862  cytochrome c, class I  67.32 
 
 		 268 aa  339  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42120  hypothetical protein  64.39 
 
 		 273 aa  331  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3572  hypothetical protein  64.86 
 
 		 272 aa  330  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23840  Cytochrome c, class I  66.39 
 
 		 268 aa  318  7.999999999999999e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  49.08 
 
 		 277 aa  247  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  47.46 
 
 		 280 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3509  cytochrome c, class I  49.07 
 
 		 278 aa  242  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  48.7 
 
 		 278 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  48.7 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  48.7 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3154  signal peptide protein  47.06 
 
 		 278 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.430229 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  48.16 
 
 		 278 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4008  hypothetical protein  43.48 
 
 		 286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3894  hypothetical protein  43.48 
 
 		 286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463258 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4362  cytochrome c, class I  43.31 
 
 		 295 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4636  putative cytochrome c  40.56 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1608  cytochrome c, class I  27.86 
 
 		 295 aa  90.5  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1406  hypothetical protein  25.12 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1587  hypothetical protein  24.88 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1775  cytochrome c family protein  26.79 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  37.23 
 
 		 384 aa  48.9  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3336  cytochrome c class I  33.73 
 
 		 117 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0198059  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  35.79 
 
 		 311 aa  46.2  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0773  cytochrome c, class I  25.23 
 
 		 309 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206884  normal  0.196899 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05464  cytochrome c  33.7 
 
 		 718 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3330  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  33.66 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  29.46 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0910  cytochrome c class I  32.53 
 
 		 117 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.58157e-33 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  41.38 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  36.26 
 
 		 382 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  36.26 
 
 		 382 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2730  cytochrome c550, putative  33.71 
 
 		 148 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0787829  normal  0.668449 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3334  cytochrome c family protein, putative  36.59 
 
 		 104 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3251  cytochrome c class I  27.14 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  27.78 
 
 		 101 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2076  cytochrome c class I  28.81 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1833  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.76 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  31.63 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1479  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.76 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1660  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.76 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0290388  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0644  cytochrome c, class I  32.05 
 
 		 474 aa  43.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.865539  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2676  hypothetical protein  29.17 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.543217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1295  cytochrome c class I  32.48 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  30.33 
 
 		 270 aa  42.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>