27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4636 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4636  putative cytochrome c  100 
 
 		 290 aa  587  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4008  hypothetical protein  65.52 
 
 		 286 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3894  hypothetical protein  65.52 
 
 		 286 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463258 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4362  cytochrome c, class I  62.12 
 
 		 295 aa  362  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1738  cytochrome c, class I  39.64 
 
 		 275 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1419  cytochrome c  41.15 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2862  cytochrome c, class I  40.58 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42120  hypothetical protein  40.51 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1841  cytochrome c family protein  41.15 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.858581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3869  hypothetical protein  40.54 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.064259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1450  cytochrome c  40.56 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.901546 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23840  Cytochrome c, class I  42.23 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3572  hypothetical protein  40 
 
 		 272 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2593  hypothetical protein  37.77 
 
 		 269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.572119  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  36.46 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  36.46 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  36.46 
 
 		 278 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  35.86 
 
 		 280 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3509  cytochrome c, class I  37.05 
 
 		 278 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3154  signal peptide protein  35.38 
 
 		 278 aa  162  9e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.430229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  35.97 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  38 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1608  cytochrome c, class I  29.17 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1775  cytochrome c family protein  26.13 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0773  cytochrome c, class I  23.83 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206884  normal  0.196899 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1587  hypothetical protein  21.05 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1406  hypothetical protein  20.75 
 
 		 291 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>