44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_23840 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_23840  Cytochrome c, class I  100 
 
 		 268 aa  530  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42120  hypothetical protein  67.94 
 
 		 273 aa  351  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1738  cytochrome c, class I  62.26 
 
 		 275 aa  351  7e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3572  hypothetical protein  67.43 
 
 		 272 aa  347  8e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2593  hypothetical protein  63.32 
 
 		 269 aa  344  8.999999999999999e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.572119  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1419  cytochrome c  64.63 
 
 		 266 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1450  cytochrome c  65.85 
 
 		 266 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.901546 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2862  cytochrome c, class I  60.15 
 
 		 268 aa  318  6e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3869  hypothetical protein  63.41 
 
 		 266 aa  318  6e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.064259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1841  cytochrome c family protein  63.82 
 
 		 266 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.858581  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3154  signal peptide protein  45.09 
 
 		 278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.430229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  45.49 
 
 		 277 aa  208  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3509  cytochrome c, class I  46.07 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  46.89 
 
 		 278 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  44.57 
 
 		 278 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  44.57 
 
 		 278 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  44.57 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  42.39 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4362  cytochrome c, class I  42.56 
 
 		 295 aa  185  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4008  hypothetical protein  40.08 
 
 		 286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4636  putative cytochrome c  42.23 
 
 		 290 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3894  hypothetical protein  40.08 
 
 		 286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463258 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1608  cytochrome c, class I  30.49 
 
 		 295 aa  95.9  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1775  cytochrome c family protein  27.02 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1406  hypothetical protein  22.69 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1587  hypothetical protein  21.62 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05464  cytochrome c  32.98 
 
 		 718 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  35.48 
 
 		 382 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  35.48 
 
 		 382 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  35.92 
 
 		 384 aa  45.8  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0773  cytochrome c, class I  27.69 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206884  normal  0.196899 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3948  aldehyde dehydrogenase family protein, putative/cytochrome c family protein, putative  32.63 
 
 		 1187 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.564465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1889  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  33.68 
 
 		 1187 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1824  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  30.91 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  35.24 
 
 		 388 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44360  putative cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.18 
 
 		 308 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3583  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  31.58 
 
 		 1187 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3776  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  28.18 
 
 		 308 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2582  cytochrome c, class I  25.93 
 
 		 133 aa  43.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.170551 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2513  cytochrome c family protein  35.29 
 
 		 146 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1877  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.35 
 
 		 325 aa  43.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.020094  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2135  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  32.38 
 
 		 1187 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.270413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3648  cytochrome c class I  28 
 
 		 147 aa  42.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00073069  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  24.42 
 
 		 101 aa  42.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>