40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_42120 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_42120  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3572  hypothetical protein  93.77 
 
 		 272 aa  510  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2593  hypothetical protein  68.48 
 
 		 269 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.572119  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1738  cytochrome c, class I  65.56 
 
 		 275 aa  359  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23840  Cytochrome c, class I  69.2 
 
 		 268 aa  337  9e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1419  cytochrome c  66.67 
 
 		 266 aa  331  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1450  cytochrome c  65.85 
 
 		 266 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.901546 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2862  cytochrome c, class I  64.53 
 
 		 268 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1841  cytochrome c family protein  64.23 
 
 		 266 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.858581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3869  hypothetical protein  63.82 
 
 		 266 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.064259 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  46.49 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3154  signal peptide protein  48.02 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.430229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3509  cytochrome c, class I  47.43 
 
 		 278 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  46.84 
 
 		 278 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  45.96 
 
 		 278 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  45.59 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  45.59 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  44.61 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4362  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3894  hypothetical protein  40.16 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4008  hypothetical protein  40.16 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4636  putative cytochrome c  40.8 
 
 		 290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1608  cytochrome c, class I  31 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1587  hypothetical protein  26.47 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0773  cytochrome c, class I  26.86 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206884  normal  0.196899 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1406  hypothetical protein  26.47 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1775  cytochrome c family protein  31.47 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  29.07 
 
 		 101 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1387  cytochrome c, class I  28.4 
 
 		 133 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  30.48 
 
 		 384 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  37 
 
 		 327 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  29.35 
 
 		 273 aa  43.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44360  putative cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.52 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  27.47 
 
 		 1139 aa  43.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  29.89 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3776  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  31.52 
 
 		 308 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0014  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.78 
 
 		 293 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0822  nitric oxide reductase, cytochrome c-containing subunit  29.59 
 
 		 277 aa  42.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  27.17 
 
 		 278 aa  42  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  31.62 
 
 		 259 aa  42  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>