26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1608 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1608  cytochrome c, class I  100 
 
 		 295 aa  614  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1775  cytochrome c family protein  31.88 
 
 		 272 aa  122  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42120  hypothetical protein  31 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3572  hypothetical protein  31 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2593  hypothetical protein  28.31 
 
 		 269 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.572119  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23840  Cytochrome c, class I  30.49 
 
 		 268 aa  95.9  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1450  cytochrome c  30.13 
 
 		 266 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.901546 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1419  cytochrome c  29.09 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1841  cytochrome c family protein  29.6 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.858581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1738  cytochrome c, class I  27.71 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3869  hypothetical protein  28.76 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.064259 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  32.74 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2862  cytochrome c, class I  28.92 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  34.59 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  35.67 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  35.22 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  35.22 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3509  cytochrome c, class I  31.49 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3154  signal peptide protein  34.9 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.430229 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  35.33 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3894  hypothetical protein  27.84 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4008  hypothetical protein  27.84 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4362  cytochrome c, class I  29.05 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4636  putative cytochrome c  29.17 
 
 		 290 aa  53.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305969  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1406  hypothetical protein  22.17 
 
 		 291 aa  49.3  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1587  hypothetical protein  21.72 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>