29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1387 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1387  cytochrome c, class I  100 
 
 		 133 aa  276  6e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0105  putative cytochrome c, class I precursor  50 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.366787 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1936  cytochrome c class I  42.53 
 
 		 188 aa  93.6  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0891775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1744  cytochrome c, class I  45.98 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2508  cytochrome c class I  36.52 
 
 		 150 aa  90.5  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4058  cytochrome c class I  42.11 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3782  cytochrome c class I  42.11 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.637528  normal  0.789636 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3973  cytochrome c class I  36.56 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.558222  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  31.37 
 
 		 280 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  31.37 
 
 		 278 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  31.37 
 
 		 278 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  31.37 
 
 		 278 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  28.21 
 
 		 277 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3509  cytochrome c, class I  31.07 
 
 		 278 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  30.43 
 
 		 278 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3999  hypothetical protein  26.56 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42120  hypothetical protein  28.4 
 
 		 273 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3572  hypothetical protein  27.16 
 
 		 272 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2593  hypothetical protein  30.26 
 
 		 269 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.572119  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  31.08 
 
 		 407 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2676  hypothetical protein  51.72 
 
 		 269 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.543217 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1278  cytochrome c, class I  31.08 
 
 		 407 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0536255  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  28.26 
 
 		 101 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3869  hypothetical protein  29.73 
 
 		 266 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.064259 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.73 
 
 		 298 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.168664  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.94 
 
 		 852 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2862  cytochrome c, class I  28.17 
 
 		 268 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23840  Cytochrome c, class I  27.16 
 
 		 268 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1841  cytochrome c family protein  29.73 
 
 		 266 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.858581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>